[发明专利]与水牛泌乳相关基因SREBP1及其作为分子标记的应用有效
| 申请号： | 201710098017.9 | 申请日： | 2017-02-23 |
| 公开（公告）号： | CN106967722B | 公开（公告）日： | 2020-06-12 |
| 发明（设计）人： | 邓廷贤;梁贤威;马小娅;庞春英;梁莎莎;陆杏蓉;朱鹏;段安琴 | 申请（专利权）人： | 广西壮族自治区水牛研究所 |
| 主分类号： | C12N15/12 | 分类号： | C12N15/12;C12Q1/6888 |
| 代理公司： | 北京天奇智新知识产权代理有限公司 11340 | 代理人： | 但玉梅 |
| 地址： | 530001 广西壮*** | 国省代码： | 广西;45 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 水牛 相关 基因 srebp1 及其 作为 分子 标记 应用 | ||
1.一种选育具有高乳品质的奶水牛品种的方法，其特征在于：所述奶水牛的选育包括产奶量高的奶水牛和奶中的乳糖率高的奶水牛；
应用SREBP1中的C8358T-CC的基因型进行判定和选育产奶量高的奶水牛；
应用SREBP1中的G15224T-GT的基因型进行判定和选育产奶量高的奶水牛；
应用SREBP1中的G15224T-TT的基因型进行判定和选育产奶中乳糖率高的奶水牛；
SREBP1基因核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其中第8358bp、15224bp处分别有C8358T、G15224T单碱基突变。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：其第8358bp、15224bp的SNP位点是通过以下步骤获得的：
a.待测水牛基因组DNA提取；
b.目的片段扩增及测序：随机取50头水牛基因组DNA进行混池，以作为PCR反应模板，利用正、反引物进行PCR技术扩增，获得的扩增产物进行测序，利用DNAStar 7.0 Seqman生物信息分析软件对测序结果进行比对，获取候选SREBP1基因SNP位点；
c.基因分型：针对384头水牛基因组DNA样本，利用飞行时间质谱法进行候选SNP位点的分型，根据质谱峰图判读各样本位点的基因型；
d.关联分析：利用SAS9.4软件GLM程序对水牛个体的SNP分型结果以及产奶量、奶中的乳蛋白率和奶中乳糖率数据进行数据分析，获得与水牛的产奶量、奶中的乳蛋白率和奶中乳糖率显著相关的SNP位点。
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于：步骤b中用于PCR技术扩增的正、反引物分别为：
(ⅰ) 获得C8358T位点的引物序列为：
正向引物SEQ NO:2：5’-CTGTGAGCGTGGGCTCCTGCGGG-3’；
反向引物SEQ NO:3：5’- GTCATTGATGGAAGAGCGGTAG -3’；
(ⅱ) 获得 G15224T位点的引物序列为：
正向引物SEQ NO:4：5’- GAGCTCTTACCTGCAGCTTCT-3’；
反向引物SEQ NO:5：5’- CTCTCGGCCGCTGATACGG -3’。
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