[发明专利]基于人RNA聚合酶I系统的肠道病毒68型微复制子体系及其构建方法有效
申请号: | 201710004793.8 | 申请日: | 2017-01-04 |
公开(公告)号: | CN106636162B | 公开(公告)日: | 2019-10-18 |
发明(设计)人: | 王涛;潘明磊;王志云;周振威 | 申请(专利权)人: | 天津大学 |
主分类号: | C12N15/70 | 分类号: | C12N15/70;C12N15/66;C12N1/21;C12R1/19 |
代理公司: | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人: | 宋洁瑾 |
地址: | 300072*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 rna 聚合 系统 肠道病毒 68 复制子 体系 及其 构建 方法 | ||
1.一种基于RNA聚合酶I系统的肠道病毒68型微复制子体系的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)公司合成EV-D68 Fermon病毒株的5’UTR cDNA;所述Fermon的5’UTR核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;
(2)以步骤(1)得到的cDNA为模板,以SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3为引物,PCR扩增得到肠道病毒68型毒株Fermon的5’UTR片段;
(3)以实验室保存pcDNA3.1-f-Luc质粒为模板,以SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5为引物,PCR扩增得到f-Luc片段;
(4)以步骤(2)得到的PCR产物和步骤(3)得到的PCR产物为模板,以SEQ ID NO:6和SEQID NO:7为引物进行overlapping-PCR扩增;回收混合PCR产物;
(5)以步骤(4)得到的PCR产物为模板,以SEQ ID NO:6和SEQ ID NO:8为引物进行PCR扩增;
(6)Pst1和Not1双酶切经步骤(5)得到的PCR产物和VR1012载体,连接,筛选阳性克隆;
(7)以步骤(6)得到的阳性克隆为模板,以SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10为引物,PCR扩增,PCR产物经DpnI酶37℃处理30分钟,转化感受态大肠杆菌DH5α,筛选获得无BsmB1酶切位点的f-Luc微复制子片段;
(8)以步骤(7)得到的处理后的质粒为模板,以SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12为引物,PCR扩增得到带有BsmB1酶切位点的f-Luc微复制子片段;
(9)BsmB1酶切步骤(8)得到的PCR产物和pHH21载体,连接,筛选阳性克隆,即为RNA聚合酶I系统的肠道病毒68型f-Luc微复制子;
(10)以步骤(9)得到的pHH21-EV-D68-f-Luc为模板,以SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14为引物,PCR扩增,PCR产物经DpnI酶37℃处理30分钟,转化感受态大肠杆菌DH5α,得到5’UTR108-207碱基缺失的EV-D68微复制子突变体:pHH21-EV-D68Δ180-207-f-Luc。
2.根据权利要求1所述的基于RNA聚合酶I系统的肠道病毒68型微复制子体系的构建方法,其特征在于,步骤(4)中所述overlapping-PCR的程序为95℃30s,53℃30s,72℃1.5min,五个循环,之后95℃30s,53℃30s,72℃1min,25个循环。
3.根据权利要求1所述的基于RNA聚合酶I系统的肠道病毒68型微复制子体系的构建方法,其特征在于,步骤(7)和(10)中所述PCR的程序为95℃20s,55℃20s,72℃5min,18个循环。
4.权利要求1-3任一项所述的基于RNA聚合酶I系统的肠道病毒68型微复制子体系的构建方法得到的肠道病毒68型微复制子体系。
5.一种包含权利要求4所述的肠道病毒68型微复制子体系的宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞为DH5α。
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