[发明专利]使用染色体相互作用的位点的检测方法

权利要求书

1.用于检测选自表39中的染色体相互作用的试剂制备用于通过在来自受试者的样品中检测表39中所示的至少10个染色体的相互作用的存在或不存在来测定所述受试者中对癌症的免疫疗法的响应性的试剂盒的用途，从而测定所述受试者中所述对免疫疗法的响应性，其中：

-所述试剂是一组10个探针，所述10个探针选自表39中所示的探针，所述探针一起对应于确定存在或不存在的所述10个染色体的相互作用，以及

-所述免疫疗法是抗PD-1疗法、抗PD-L1疗法或组合的抗PD-1/抗PD-L1疗法，并且

-所述癌症是黑色素瘤。

2.根据权利要求中1所述的用途，其中染色体的相互作用的存在或不存在的所述检测通过包括以下步骤的方法进行：

(i)在所述样品中存在的表观遗传染色体相互作用的体外交联；

(ii)任选地分离所述交联的DNA；

(iii)对所述交联的DNA进行切割；和

(iv)连接所述交联的切割的DNA末端以形成连接的DNA；以及

(v)使用所述10个探针来鉴定所述连接的DNA的存在，

从而确定所述染色体相互作用的存在或不存在。

3.根据权利要求1或2所述的用途，其中测定表52中所示的染色体相互作用的存在或不存在。