[发明专利]应用于第二代高通量测序的全自动RNA文库制备装置有效
申请号: | 201611190715.3 | 申请日: | 2016-12-21 |
公开(公告)号: | CN106754309B | 公开(公告)日: | 2019-04-26 |
发明(设计)人: | 尚小云;李艳艳;张凯宁;靖相密;安苗苗 | 申请(专利权)人: | 山东艾克韦生物技术有限公司 |
主分类号: | C12M1/34 | 分类号: | C12M1/34;C12Q1/6869;C12N15/10;C40B50/06;C40B60/14 |
代理公司: | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人: | 张贵宾 |
地址: | 250000 山东省济南市高*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 文库 盒体 构建 高通量测序 制备装置 试剂仓 收集池 测序 测序平台 独立操作 盒体顶部 盒体内部 末端修复 全程封闭 外界接触 反转录 废液槽 进样口 密封盖 取样针 样品池 放入 建库 应用 取出 污染 | ||
本发明涉及一种应用于第二代高通量测序的全自动RNA文库制备装置。包括盒体,盒体的顶面上设置进样口、文库转移口,盒体底部分别设置1个文库收集池、1个样品池、9个试剂仓、1个废液槽,装置测序方法,步骤:将RNA文库构建所用到所有试剂都预先放入盒体底部的试剂仓中,RNA样品经反转录为cDNA、DNA片段化、末端修复、加接头、PCR扩增并纯化后,取样针把构建好的文库转移至文库收集池中,将盒体顶部的密封盖打开,通过文库转移口取出构建好的文库,然后就放到测序平台上进行测序。整个建库过程都在盒体内部完成,全程封闭,不与外界接触,不会产生污染,即使是本领域内的普通技术人员都能独立操作实施,提高了效率。
(一)技术领域
本发明属于生物医疗器械技术领域,特别涉及一种应用于第二代高通量测序的全自动RNA文库制备装置。
(二)背景技术
作为最重要的分子生物学分析方法之一,测序技术的出现不仅为遗传信息的揭示和基因表达调控等基础生物学研究提供重要数据,而且在基因诊断和基因治疗等应用研究中也发挥着重要的作用。
高通量测序技术是测序发展历程的一个里程碑,它为现代生命科学研究提供了前所未有的机遇。第二代高通量测序技术(二代测序)可进行基因组测序、转录组测序、基因表达调控、转录因子结合位点的检测以及甲基化等研究。二代测序也是在目前用于解析遗传病遗传机制、药物基因组学、肿瘤个性化治疗、生物标记物鉴定等问题应用最为广泛也最直接的技术手段。
在二代测序的实验步骤中,测序文库的制备是非常关键的一步。传统测序文库的制备需要样本核酸提取、酶前处理或机械剪切、加接头进行链结、PCR扩增等等工序,操作复杂,自动化程度不高。同时为了避免污染,以上操作需要在不同的实验室中进行,对实验室物理空间分布具有严格要求,并且需要操作人员经过专业培训,否则将影响后续测序结果的准确性。
(三)发明内容
本发明为了弥补现有技术第二代测序文库制备技术自动化程度低且操作过程中易引入污染,从而影响测序结果的准确性,并且操作程序专业繁琐,非专业人士不能独立完成的不足,提供了一种应用于第二代高通量测序的全自动RNA文库制备装置,该应用于第二代高通量测序的全自动RNA文库制备装置将建库与纯化的过程完全自动化,且实现全封闭操作,实现零污染、高重复性的文库制备,也解决部分实验室物理空间不足的难题。
本发明是通过如下技术方案实现的:
一种应用于第二代高通量测序的全自动RNA文库制备装置,包括盒体,盒体的顶面上设置进样口,其特殊之处在于:还设置文库转移口,进样口、文库转移口上设置可左右滑动以封闭或打开进样口、文库转移口的密封盖,盒体底部分别设置1个文库收集池、1个样品池、9个试剂仓、1个废液槽,其中,样品池与进样口相对设置,文库收集池与文库转移口相对设置,盒体内分别设置螺杆、取样针,所述螺杆左、右两端分别经轴承三、轴承四与盒体相应侧转动连接,螺杆水平设置,螺杆的右端伸出盒体与螺杆旋钮相连,螺杆上设置连接件,该连接件与螺杆通过螺纹相连,连接件的顶面上设置有取样针容置孔,取样针容置孔的中心轴与螺杆的中心轴垂直,取样针容置孔底部固定设置第一弹簧,第一弹簧与取样针容置孔通轴设置,第一弹簧由取样针容置孔底部向上延伸并伸出取样针容置孔,取样针套设在第一弹簧内,取样针通过管道与负压发生器连通,负压发生器包括壳体、活塞和活塞杆,活塞杆上套有第二弹簧,活塞杆的自由端固定连接压杆针的左端,压杆针的右端伸出盒体,用于推进活塞杆,取样针的上方设置有压板,压板包括压板本体及与压板本体连接的压板轴,其中,压板轴与螺杆平行设置,压板轴的左端通过轴承一与盒体转动连接,压板轴的右端通过轴承二与盒体转动连接, 压板轴的右端伸出盒体与压板旋转相连,
应用于第二代高通量测序的全自动RNA文库制备装置测序方法,包括以下步骤:
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