[发明专利]一种基于16SrDNA测序的榨菜专用直投式发酵剂定向制备方法在审
申请号: | 201611162936.X | 申请日: | 2016-12-15 |
公开(公告)号: | CN106834435A | 公开(公告)日: | 2017-06-13 |
发明(设计)人: | 刘大群;童川 | 申请(专利权)人: | 浙江省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 杭州杭诚专利事务所有限公司33109 | 代理人: | 尉伟敏,司敏 |
地址: | 310021 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 16 srdna 榨菜 专用 直投式 发酵剂 定向 制备 方法 | ||
1.一种基于16S rDNA测序的榨菜专用直投式发酵剂定向制备方法,其特征在于至少包括以下步骤:
(1)于榨菜盐渍池中取样,样品置于无菌冷冻管中,立即放入液氮中保存,然后置于超低温冰箱中,
(2)提取样品DNA并做琼脂糖凝胶电泳检测后做PCR,扩增16S rDNA,所述的PCR扩增的特异性引物的上游引物515F具有如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列,特异性引物的下游引物907R具有如SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列,PCR扩增区域为微生物16S rDNA的V4-V5可变区域,测序前需对所述PCR产物进行回收纯化,
(3)将步骤(2)获得的PCR产物进行高通量测序并做比对分析,确定优势菌群种类与组成比例,
(4)优势菌株的定向筛选,
(5)定向筛选菌株的高密度增殖培养,
(6)离心并冷冻干燥,
将步骤(5)经高密度增值培养的菌液加入脱脂奶粉,摇匀后离心,去除上清培养液,收集试管底部菌体;收集的菌体加入冻干保护剂后做冷冻干燥,其中:菌体与冻干保护剂质量分数配比为1:3-1:2.5,
(7)将步骤(6)得到的各定向筛选和高密度增值培养的菌株冷冻干燥粉按照16S rDNA测序确定的优势菌群种类与组成比例混合,制得榨菜专用直投式发酵剂。
2.如权利要求1所述的一种基于16S rDNA测序的榨菜专用直投式发酵剂定向制备方法,其特征在于,所述的步骤(1)中取样采用3点取样法,采集点分别位于盐渍池中心、盐渍池对角线两点,每处采集3次样品,采集后混匀。
3.如权利要求1所述的一种基于16S rDNA测序的榨菜专用直投式发酵剂定向制备方法,其特征在于,所述的步骤(4)优势菌株的定向筛选按如下操作:在所述步骤(1)的所取样品中,取1ml液体于生理盐水中进行10倍的梯度稀释,均匀涂布在定向培养基上,然后在35~37℃恒温箱中定向培养36~72h,观察菌落;然后将定向培养的菌株进行生理生化特征鉴定实验;根据鉴定结果,将定向筛选后的菌株进行斜面培养。
4.如权利要求1所述的一种基于16S rDNA测序的榨菜专用直投式发酵剂定向制备方法,其特征在于,所述的步骤(5)定向筛选菌株的高密度增殖培养按如下步骤操作:将上述步骤(4)定向筛选与纯化培养的菌株进行高密度增值培养,高密度增值培养基为MRS琼脂培养基,培养条件为35~37℃恒温箱中培养48~72h;所述的MRS琼脂培养基配方为:蛋白胨10.0克、牛肉膏5.0克、酵母粉4.0克、葡萄糖20.0克、吐温80 1.0毫升、磷酸氢二钾2.0克、乙酸钠5.0克、柠檬酸三胺2.0克、硫酸镁0.2克、硫酸锰0.05克、琼脂粉15.0克和蒸馏水1升,加热溶解后,校正pH=6.2~7.2,121℃高压灭菌15~20分钟。
5.如权利要求1所述的一种基于16S rDNA测序的榨菜专用直投式发酵剂定向制备方法,其特征在于,所述的步骤(6)中将步骤(5)经高密度增值培养的菌液,加入2.7~3.5%经高温灭菌的脱脂奶粉,摇匀后以4000-5000rpm转速于-5~10℃条件下离心25-30分钟。
6.如权利要求1所述的一种基于16S rDNA测序的榨菜专用直投式发酵剂定向制备方法,其特征在于,所述的步骤(6)中冻干保护剂配方为:脱脂乳25-30克、乳糖10-15克、葡糖糖5-12克、维生素C5-6.5克、D-山梨醇5-7.2克、L-谷氨酸5-6克和蒸馏水250mL;冻干保护剂加热溶解后,121℃高压灭菌15-20分钟后备用。
7.如权利要求1所述的一种基于16S rDNA测序的榨菜专用直投式发酵剂定向制备方法,其特征在于,所述的步骤(6)中冷冻干燥的主要工艺参数为:-50~-70℃预冻12-24h后,-60~80℃冻干24-72h。
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