[发明专利]一种基于堆叠自动编码网络的多模态脑肿瘤图像分割方法在审
申请号: | 201611115061.8 | 申请日: | 2016-12-07 |
公开(公告)号: | CN106780499A | 公开(公告)日: | 2017-05-31 |
发明(设计)人: | 丁熠;秦臻;董荣凤 | 申请(专利权)人: | 电子科技大学 |
主分类号: | G06T7/10 | 分类号: | G06T7/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 611731 四川省成*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 堆叠 自动 编码 网络 多模态脑 肿瘤 图像 分割 方法 | ||
1.本发明是一种基于堆叠自动编码网络的多模态脑肿瘤图像分割方法。主要包括以下内容:首先对图像进行预处理,然后利用多模态成像原理,实现对非正常脑组织区域的多分类。
技术方案如下:
步骤一:将非正常脑组织成像数据mha进行切片,得到二维bmp图像。
步骤二:将得到的二维图像进行预处理,提高病变区域和非病变区域的对比度,然后对图像进行归一化处理。
步骤三:分别对flair,T1,T2,T1c图像中的点提取一个15×15的图像块,将图像块进行堆叠成为一个4×15×15的矩阵。将每个图像块的灰度转换为一个4×225维的向量,依次排列形成输入矩阵;。
步骤四:同时设立四个SAE(堆叠降噪自动编码器)网络。
步骤五:对每一个SAE深度学习网络,设定SAE深度学习网络的隐层节点数,将矩阵作为输入,进行预训练,获取最初的网络参数;
步骤六:在网络的顶部增加一个输出层,利用带标签的数据对网络参数进行微调得到最终的参数;
步骤七:使用得到的参数初始化一个新的分类网络,对需要测试的图像,为其提取同样大小的图像块,并形成同样的灰度矩阵,把这个灰度矩阵输入到分类网络中,得到最初的分类结果。
步骤八:分别从四个SAE网络中获取病变区域的分类,将结果映射到一个与原图大小相同的空白图像上面。
步骤九:使用连通分量的方法对图像进行后处理,限定分割图像的连通数。
步骤十:使用开运算和闭运算对分割后的图像边缘进行平滑处理。
2.根据权利要求1所述的堆叠自动编码器网络实现对病人脑肿瘤区域的分割方法,其特征在于所述步骤三中的所述,对二维图像进行分块提取,具体实现步骤如下:
分别从flair、T1、T2、T1c图像上面提取15×15的图像块,然后将这些图像块堆叠成4×15×15的矩阵。然后得到一个4×225维的向量,一共得到N个二维向量。将这些二维向量按照从上到下的顺序进行排列,形成输入矩阵X。
3.根据权利要求1所述的堆叠自动编码器网络实现对病人脑肿瘤区域的分割方法,其特征在于所述步骤八中的所述,四个深度学习网络进行病变区域的提取,具体实现步骤如下:
根据flair图片的成像原理,从网络1中提取水肿区域特征N1,映射到一个空白图像上得到图像X,然后根据T1成像原理,从网络2中提取肿瘤增强部分特征N2,映射到X上面,得到X1;然后根据T1C成像原理,从网络3中提取肿瘤部分特征N3,映射到X1上面,得到X2;然后根据T2成像原理,从网络4中提取坏死部分特征N4,映射到X2上面,得到X3;X3就是最后的分割结果。
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