[发明专利]基于G-四链体-血红素复合物和聚合链式放大反应检测单链目标DNA浓度的电化学方法有效
申请号: | 201611062398.7 | 申请日: | 2016-11-28 |
公开(公告)号: | CN106525940B | 公开(公告)日: | 2018-11-30 |
发明(设计)人: | 周楠迪;孙笑凡;王淑玲;田亚平 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
主分类号: | G01N27/327 | 分类号: | G01N27/327 |
代理公司: | 无锡市大为专利商标事务所(普通合伙) 32104 | 代理人: | 时旭丹;张仕婷 |
地址: | 214122 江苏省无锡市滨*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 目标DNA 四链体 血红素复合物 捕获探针 电化学 电极表面 反应检测 辅助探针 聚合链 单链 放大 差分脉冲伏安法 分析化学技术 聚合链式反应 电化学信号 金电极表面 四链体结构 核酸序列 化学信号 碱基序列 特异性强 复合物 聚集体 灵敏度 血红素 电极 检测 链状 强电 扫描 引入 | ||
1.一种基于G-四链体-血红素复合物和聚合链式放大反应检测单链目标DNA浓度的电化学方法,其将捕获探针固定到金电极上,然后将不同浓度的目标DNA、辅助探针和固定在电极表面的捕获探针混合杂交,电化学法检测响应电流值;具体步骤如下:
(1)金电极的预处理:将金电极在氧化铝粉末上打磨;后依次在超纯水、无水乙醇、超纯水中40KHz超声清洗2-3 min;清洗结束后将金电极插入到0.5M H2SO4溶液中循环伏安法扫描活化,扫描范围从-0.4V至+1.5V,扫描速度100mV/s,直到获得稳定的CV图为止;将处理后的金电极用超纯水冲洗并用氮气吹干;
(2)捕获探针的固定:将合成好的捕获探针用10mM PBS缓冲液溶解,-20℃冰箱中保藏;将捕获探针用PBS缓冲液稀释;将100μL、0.3μM的捕获探针溶液倒扣到步骤(1)处理所得金电极上,使得捕获探针在金电极表面上形成自组装单分子层;用2mM巯基己醇封闭金电极4h,得到修饰有捕获探针的金电极;用超纯水淋洗电极,氮气吹干待用;
(3)捕获探针、目标DNA以及辅助探针之间的杂交:将步骤(2)所得修饰有捕获探针的金电极浸没到100 μL的反应体系中,室温反应2h;所述反应体系为:0.8μM辅助探针、一定浓度的目标DNA、双蒸水及20mM PBS缓冲液;
(4)G-四链体-血红素复合物的形成:将200μL的G-四链体形成液倒扣在电极上,室温下放置30min;向G-四链体形成液中加入2μL 20mM血红素混匀;将反应液继续倒扣到电极上,室温下放置1h;用超纯水冲洗电极,用于电化学检测;
(5)电化学检测:
a、电化学反应:采用三电极系统,步骤(4)所得金电极作为工作电极,Ag/AgCl作为参比电极,铂丝作为对电极;工作溶液为含pH 7.4、20 mM KCl的20 mM HEPES缓冲液,检测前先通入氮气30 min;
b、标准曲线的绘制:检测方法为差分脉冲伏安法DPV,扫描范围-0.6~-0.15 V,振幅50mV;取一系列不同浓度的目标DNA,以步骤(1)-(4)同样操作后对其进行检测,绘制峰电流和目标DNA浓度的关系曲线;
c、检测:对于未知浓度目标DNA样品,按上述步骤(1)-(4)同样操作后对其进行检测,测得峰电流后从标准曲线可读出其浓度值;
其特征在于:所述辅助探针两端均含有能与目标DNA互补配对的核酸序列,而中间含有能形成G-四链体的碱基序列,具体为
5’-目标序列后11个碱基的互补序列+ TTTGGGTAGG GCGGGTTGGG CT+目标序列前11个碱基的互补序列-3’;
所述捕获探针具体为5’-HS-(CH2)6-TT+目标序列前11个碱基的互补序列-3’。
2.根据权利要求1所述基于G-四链体-血红素复合物和聚合链式放大反应检测单链目标DNA浓度的电化学方法,其特征在于:所述PBS缓冲液中含有1mM Mg2+、1M NaCl,其pH为7.4。
3.根据权利要求1所述基于G-四链体-血红素复合物和聚合链式放大反应检测单链目标DNA浓度的电化学方法,其特征在于:所述G-四链体形成液为每10 mM HEPES缓冲液中含有50mM KCl,其pH为8.0。
4.权利要求1所述基于G-四链体-血红素复合物和聚合链式放大反应检测单链目标DNA浓度的电化学方法的应用,其特征在于:对HIV DNA样品的浓度进行了检测,以HIV基因片段作为目标DNA,其序列为:
5’- GGCAGCAATT TCACCAGTAC TA -3’ ;
相应的,设计其捕获探针序列为:5’- HS-(CH2)6-TTTAGTACTG GTG -3’;
设计辅助探针序列为:
5’-AAATTGCTGC CTTT
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