[发明专利]用于检测兹卡病毒的LAMP引物组合及其应用

说明书

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一种用于检测兹卡病毒的LAMP引物组合及其应用。

背景技术

兹卡病毒病(Zika Virus Disease)是由兹卡病毒(Zika Virus)引起并通过蚊媒传播的一种自限性急性疾病。兹卡病毒属黄病毒科，黄病毒属，单股正链RNA病毒，是一种通过蚊虫进行传播的虫媒病毒，宿主不明确，主要在野生灵长类动物和栖息在树上的蚊子(如非洲伊蚊)中循环。

兹卡病毒最早于1947年偶然通过黄热病监测网络在乌干达寨卡丛林的恒河猴中发现，随后于1952年在乌干达和坦桑尼亚人群中发现。兹卡病毒活动一直比较隐匿，仅在赤道周围的非洲、美洲、亚洲和太平洋地区有兹卡病毒感染散发病例。最早一次暴发流行是2007年发生在西太平洋密克罗尼亚群岛的雅铺岛，更大的一次流行于2013-2014年发生在大洋洲的法属波利尼西亚，感染了约32000人。2015年5月，巴西报告首例寨卡病毒病病例，截至2016年1月底，巴西等24个美洲国家和地区报告本地感染病例。同时，欧洲、北美等地的多个国家报告发现输入性病例，我国也报告2例输入性病例。

兹卡病毒病的临床特征主要为发热、皮疹、关节痛或结膜炎，极少引起死亡。世界卫生组织(WHO)认为，出生缺陷类疾病新生儿小头畸形，神经系统疾病格林-巴利综合征(吉兰-巴雷综合征)可能与兹卡病毒感染有关。

我国尚未大规模爆发兹卡病毒疫情，但在世界范围内广泛分布和迅速传播。因此，对兹卡病毒的快速检测刻不容缓，已成为兹卡病毒疫情防治工作中迫切需要解决的问题。常见检测病毒的方法主要有：酶联免疫吸附法(ELISA)、聚合酶链式反应(PCR)、核酸分子杂交法、自动DNA测序等。传统的基因鉴定方法为PCR法和DNA测序法，其中传统的PCR法检测周期较长，通常需要3-4个小时；SangerDNA测序法对引物特异性要求较高，且价格较昂贵，后期数据分析较复杂，不适合临床推广使用。

发明内容

本发明的目的是提供一种用于检测兹卡病毒的LAMP引物组合及其应用。

本发明提供了一种引物组合，为如下(a1)或(a2)：

(a1)由引物组Ⅰ和引物组Ⅱ组成；

(a2)所述引物组Ⅰ或所述引物组Ⅱ；

所述引物组Ⅰ由引物Ⅰ-F3、引物Ⅰ-B3、引物Ⅰ-FIP、引物Ⅰ-BIP、引物Ⅰ-LF和引物Ⅰ-LB组成；

所述引物Ⅰ-F3为如下(b1)或(b2)；

(b1)序列表的序列1所示的单链DNA分子；

(b2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子；

所述引物Ⅰ-B3为如下(b3)或(b4)；

(b3)序列表的序列2所示的单链DNA分子；

(b4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子；

所述引物Ⅰ-FIP为如下(b5)或(b6)；

(b5)序列表的序列3所示的单链DNA分子；

(b6)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子；

所述引物Ⅰ-BIP为如下(b7)或(b8)；

(b7)序列表的序列4所示的单链DNA分子；

(b8)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子；

所述引物Ⅰ-LF为如下(b9)或(b10)；

(b9)序列表的序列5所示的单链DNA分子；

(b10)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子；

所述引物Ⅰ-LB为如下(b11)或(b12)；

(b11)序列表的序列6所示的单链DNA分子；

(b12)将序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列6具有相同功能的DNA分子；

所述引物组Ⅱ由引物Ⅱ-F3、引物Ⅱ-B3、引物Ⅱ-FIP、引物Ⅱ-BIP、引物Ⅱ-LF和引物Ⅱ-LB组成；

所述引物Ⅱ-F3为如下(c1)或(c2)；

(c1)序列表的序列7所示的单链DNA分子；

(c2)将序列7经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列7具有相同功能的DNA分子；

所述引物Ⅱ-B3为如下(c3)或(c4)；