[发明专利]肺癌组织溯源CTC分型鉴定试剂盒在审
申请号: | 201610407628.2 | 申请日: | 2016-06-08 |
公开(公告)号: | CN107475353A | 公开(公告)日: | 2017-12-15 |
发明(设计)人: | 刘苏燕;吴诗扬;董艳 | 申请(专利权)人: | 益善生物技术股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司44224 | 代理人: | 万志香 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺癌 组织 溯源 ctc 鉴定 试剂盒 | ||
1.一种肺癌组织溯源CTC分型鉴定试剂盒,其特征在于,其包括针对检测目标基因mRNA的捕获探针以及信号放大系统;所述目标基因包括有肺癌特异性基因、上皮细胞标志基因、和间质细胞标志基因,所述肺癌特异性基因选自TTF-1、SP-B、napsin-A、CK7中至少两种;所述上皮细胞标志基因选自EpCAM、CK5、CK18、CK19中的至少两种;所述间质细胞标志基因选自ZEB1、SNAI2、FOXC2、SERPINE1中至少两种;所述信号放大系统包括有末端修饰有荧光基团的扩增探针,或包括有扩增探针和末端修饰有荧光基团的标记探针,不同种类目标基因的荧光基团互不相同;其中,
所述捕获探针用于连接目标基因mRNA与扩增探针,每条捕获探针从5’端到3’端的碱基组成依次为:可与待检测的目标基因mRNA结合的特异性序列P1、间隔臂序列、P2序列,所述P2序列为不存在发夹结构,探针内部和探针间不形成二聚体、不存在错配,与P1、P4和目标基因mRNA之间均不存在特异性结合的序列,针对同一类别目标基因mRNA的捕获探针的P2序列相同;
每条扩增探针从5’端到3’端的碱基组成依次为:能与相应捕获探针的P2序列互补配对的P3序列、间隔臂序列、P4序列;所述P4序列为不存在发夹结构,探针内部和探针间不形成二聚体、不存在错配、与P1、P2、P3和总mRNA之间均不存在特异性结合的序列;
每条标记探针具有与相应扩增探针P4序列互补配对的P5序列。
2.根据权利要求1所述的肺癌组织溯源CTC分型鉴定试剂盒,其特征在于,所述目标基因还包括排除基因,所述排除基因选自CK20、CD45中至少一种。
3.根据权利要求1所述的肺癌组织溯源CTC分型鉴定试剂盒,其特征在于,所述肺癌特异性基因的捕获探针中:针对TTF-1基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.10中的2条或2条以上,针对SP-B基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.11~SEQ ID NO.20中的2条或2条以上,针对napsin-A基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.21~SEQ ID NO.30中的2条或2条以上,针对CK7基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.31~SEQ ID NO.40中的2条或2条以上。
4.根据权利要求1或3所述的肺癌组织溯源CTC分型鉴定试剂盒,其特征在于,针对肺癌特异性基因的捕获探针的特异性序列P2为SEQ ID NO.141;所述肺癌特异性基因mRNA扩增探针中,P3序列为SEQ ID NO.145,P4序列为SEQ ID NO.149。
5.根据权利要求1所述的肺癌组织溯源CTC分型鉴定试剂盒,其特征在于,所述上皮细胞标志基因的捕获探针中:针对EPCAM基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.41~SEQ ID NO.50中的2条或2条以上,针对CK5基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.51~SEQ ID NO.60中的2条或2条以上,针对CK18基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.61~SEQ ID NO.70中的2条或2条以上,针对CK19基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.71~SEQ ID NO.80中的2条或2条以上。
6.根据权利要求1或5所述的肺癌组织溯源CTC分型鉴定试剂盒,其特征在于,针对上皮细胞标志基因的捕获探针的特异性序列P2为SEQ ID NO.142;所述上皮细胞标志基因mRNA扩增探针中,P3序列为SEQ ID NO.146,P4序列为SEQ ID NO.150。
7.根据权利要求1所述的肺癌组织溯源CTC分型鉴定试剂盒,其特征在于,所述间质细胞标志基因的捕获探针中:针对ZEB1基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.81~SEQ ID NO.90中的2条或2条以上,针对SNAI2基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.91~SEQ ID NO.100中的2条或2条以上,针对FOXC2基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO101~SEQ ID NO.110中的2条或2条以上,针对SERPINE1基因的特异性序列P1选自SEQ ID NO.111~SEQ ID NO.120中的2条或2条以上。
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