[发明专利]一种与结直肠癌相关的RNA生物标志物及其应用

说明书

技术领域

本发明属于分子生物和肿瘤学领域，涉及一种与结直肠癌相关的RNA生物标志物 及其应用。

背景技术

结直肠癌(colorectalcancer,CRC)是常见的消化道恶性肿瘤，在我国发病率和 死亡率都位居第五位。全球每年有超过120万人被诊断为结直肠癌，60万人死于结直肠癌。Ⅰ 期患者5年生存率大于90％，Ⅳ期患者仅为10％。虽然近年来结直肠癌诊断和治疗的水平不 断提高，但多数患者发现肿瘤时已处于晚期，发生淋巴结或远端脏器转移，患者预后不理 想，因此深入理解结直肠癌的发生和发展机制，探寻结直肠癌诊断和治疗的新靶标意义重 大。目前结直肠癌的辅助诊断有影像学和实验室检查。影像学检查主要包括电子肠镜、钡灌 肠X线检查等。影像学检查虽然直观，但是具有对于早期癌变检出率低、容易漏检、患者依从 性差和检查费用高等局限性。目前实验室主要包括大便隐血实验和血清CEA检测，同样也是 敏感性不高，不能满足临床需求。因此，寻找能敏感性高的结直肠癌标志物迫在眉睫。

非编码RNA(non-codingRNA，ncRNA)是近年来发现的一类能转录但不编码蛋白质 且具有特定功能的RNA小分子。人类基因组计划揭示人基因组中有30亿个碱基对，其中不到 2％能够编码蛋白质，98％以上都是非蛋白质编码基因，这些基因序列一度被认为是垃圾基 因。然而随着基因组学和生物信息学的发展，尤其是高通量RNA测序技术(RNAsequencing， RNA-seq)的大量应用，发现了越来越多的非蛋白编码的转录单元，功能基因组学的飞速发 展将越来越多的目光引向了对非编码转录产物功能的研究[6]。经典非编码RNA包括 miRNAs、piRNAs、snoRNAs和lncRNAs等。近年来，一种新的非编码RNA-环状RNA(circRNA)成 为RNA领域最新的研究热点。circRNA是区别于传统线性RNA的一类新型RNA，具有闭合环状 结构，大量存在于真核转录组中。大部分的环状RNA是由外显子序列构成，在不同的物种中 具有保守性，同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状RNA对核酸酶不敏感， 所以比线性RNA更为稳定，这使得环状RNA在作为新型临床诊断标记物的开发应用上具有明 显优势。

发明内容

解决的技术问题：本发明提供一种与结直肠癌相关的RNA生物标志物及其应用。

技术方案：一种与结直肠癌相关的RNA生物标志物，序列如SEQIDNO.1所示。

所述生物标志物在筛选人类结直肠癌的肿瘤诊断药物中的应用。

一种与结直肠癌诊断相关的组合，含有SEQIDNO.1所示生物标志物的引物对。

所述引物对为5’-CAGGACGGTCAGCGTCGT-3’；5’-GGCACAGCGTTGCTAATGAC-3’。所扩 增产物大小为138bp，扩增产物序列为 CAGGACGGTCAGCGTCGTCCCCCAGACTACAGTAATACTCAACAATGATCGGCAGAACGCCATTGTAGCCAAGATGG AAGACCCCTTGAGCAACAGGGCACCGGATTCCCTGGAAAATGTCATTAGCAACGCTGTGCC。

所述引物对在制备筛查诊断结直肠癌试剂盒中的应用。

一种筛查诊断结直肠癌试剂盒，其特征在于含有上述的引物对。

有益效果：本发明提供一种与结直肠癌相关的RNA生物标志物及其应用，既可用于 筛选人类结直肠癌的肿瘤治疗药物靶点，也可制备成相关试剂盒用于结直肠癌的临床辅助 诊断。

附图说明

图1为SEQIDNO.1所示生物标志物的扩增曲线图；

图2为β-actin扩增曲线图；

图3为SEQIDNO.1所示生物标志物的熔解曲线图；

图4为β-actin熔解曲线图；

图5为SEQIDNO.1所示生物标志物的PCR产物凝胶电泳图；

图6为PCR产物DNA测序结果图；

图7为检测结直肠癌和癌旁组织SEQIDNO.1所示生物标志物的相对表达量示意 图。

具体实施方式

以下通过实施例对本发明作进一步的阐述。本实施例在以本发明技术方案为前提 下进行实施，给出了详细的实施方式和过程，但本发明的包含范围不限于下述的实施例。下 面的实施例中未注明的条件和方法等均按照常规或者制造厂商所建议的条件进行。