[发明专利]幽门螺杆菌定量和毒力多重基因检测体系及其试剂盒和应用有效
申请号: | 201610070257.3 | 申请日: | 2016-02-02 |
公开(公告)号: | CN105506160B | 公开(公告)日: | 2019-02-26 |
发明(设计)人: | 张艳梅;赵虎;赵付菊;胡彬婕;王诗雯;陈飞;吴勇;缪应新;张景皓;姜文荣;徐玲丽;南丽 | 申请(专利权)人: | 华东医院;宁波海尔施基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12N15/11 |
代理公司: | 常州金之坛知识产权代理事务所(普通合伙) 32317 | 代理人: | 蒋欣 |
地址: | 200040 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 幽门 螺杆 定量 毒力 多重 基因 检测 体系 及其 试剂盒 应用 | ||
1.一种幽门螺杆菌定量和毒力多重基因检测体系,其特征在于:包括对菌种鉴定基因16S rRNA进行检测的引物,分别对幽门螺杆菌的拷贝数进行定量分析的基因ureC和ß-globin进行检测的引物,以及分别对毒力基因cagA、vacA-s1、vacA-s2、vacA-m1、vacA-m2、iceA1、iceA2、dupA、oipA和luxS进行检测的引物,所述各引物的正向引物的5’端均设有正向通用引物序列,所述各引物的反向引物的5’端均设有反向通用引物序列;
针对16S rRNA基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,针对16S rRNA基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;
针对cagA基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,针对cagA基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示;
针对vacA-s1或vacA-s2基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示,针对vacA-s1或vacA-s2基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示;
针对vacA-m1基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.7所示,针对vacA-m1基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.8所示;
针对vacA-m2基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.9所示,针对vacA-m2基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.10所示;
针对iceA1基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.11所示,针对iceA1基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.12所示;
针对iceA2基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.13所示,针对iceA2基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.14所示;
针对dupA基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.15所示,针对dupA基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.16所示;
针对oipA基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.17所示,针对oipA基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.18所示;
针对luxS基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.19所示,针对luxS基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.20所示;
针对ureC基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.33所示,针对ureC基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.34所示;
针对ß-globin基因的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.35所示,以及针对ß-globin基因的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.36所示;
所述正向通用引物的核苷酸序列如SEQ ID No.37所示;
所述反向通用引物的核苷酸序列如SEQ ID No.38所示。
2.根据权利要求1所述的幽门螺杆菌定量和毒力多重基因检测体系,其特征在于:针对16S rRNA、ureC、cagA、vacA-s1、vacA-m1、vacA-m2、iceA1、iceA2、dupA、oipA和luxS基因的正向引物在检测体系中的终浓度均为200nM;针对16S rRNA、ureC、cagA、vacA-s1、vacA-m1、vacA-m2、iceA1、iceA2、oipA、luxS和ß-globin基因的反向引物在检测体系中的终浓度均为100nM;针对dupA基因的反向引物在检测体系中的终浓度为200nM;针对ß-globin基因的正向引物在检测体系中的终浓度为100nM。
3.根据权利要求1或2所述的幽门螺杆菌定量和毒力多重基因检测体系,其特征在于:还包括PCR缓冲液、MgCl2溶液、dNTPs、热启动DNA聚合酶、带荧光的通用标签混合物和DNA模板;所述带荧光的通用标签混合物中包括反向通用引物和带有荧光标记的正向通用引物。
4.根据权利要求3所述的幽门螺杆菌定量和毒力多重基因检测体系,其特征在于:所述荧光标记为CY5或CY3或FAM。
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