[发明专利]一种采用一步法进行DNA末端修复/加dA的方法及应用在审
申请号: | 201610040334.0 | 申请日: | 2016-01-21 |
公开(公告)号: | CN105567684A | 公开(公告)日: | 2016-05-11 |
发明(设计)人: | 孙子奎;王锋;丁方美;李嫦娥;吴帅来;朱月艳;王果 | 申请(专利权)人: | 上海派森诺生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C40B40/06 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋;侯潇潇 |
地址: | 200231 上海市徐*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 采用 一步法 进行 dna 末端 修复 da 方法 应用 | ||
1.一种采用一步法进行DNA末端修复/加dA的方法,其特征在于,所述 方法采用T4DNA聚合酶、TaqDNA聚合酶和T4多核苷酸激酶的混合酶系。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述T4DNA聚合酶、TaqDNA 聚合酶和T4多核苷酸激酶的体积比为1:(0.1-5):(1-15),优选为1:(0.3-3): (2-10),进一步优选为1:0.5:5。
3.一种采用一步法进行DNA末端修复/加dA的预混液,其特征在于,所 述预混液包括权利要求1或2所述的混合酶系、dNTPs、ATP、反应缓冲液和去 离子水。
4.根据权利要求3所述的预混液,其特征在于,所述dNTPs中的dATP和 dCTP+dTTP+dGTP的浓度比为(1-20):2,优选为(5-10):2,进一步优选为 7:2;
优选地,所述ATP的浓度为0.1-5mM,优选为0.1-3mM,进一步优选为 0.2mM。
5.根据权利要求3或4所述的预混液,其特征在于,所述反应缓冲液包括 Tris-HCl,KCl,MgCl2和DTT;
优选地,所述Tris-HCl的浓度为5-50mM,优选为10-40mM,进一步优选 为20mM;
优选地,所述KCl的浓度为10-80mM,优选为20-60mM,进一步优选为 30mM;
优选地,所述MgCl2的浓度为0.5-8mM,优选为1-5mM,进一步优选为 1.2mM;
优选地,所述DTT的浓度为1-15mM,优选为3-10mM,进一步优选为4 mM。
6.根据权利要求3-5中任一项所述的预混液,其特征在于,所述预混液为 10μL,包含以下组分:
缓冲液:
去离子水加至10μL。
7.一种如权利要求3-6中任一项所述的预混液的使用方法,其特征在于, 所述方法包括如下步骤:
(1)将待修复的DNA打断,取打断的DNA2-10ng;
(2)将步骤(1)中打断的DNA与预混液混匀,15-30℃反应后升温再反 应。
8.根据权利要求7所述的使用方法,其特征在于,步骤(2)所述打断DNA 与预混液的体积比为1:5,优选为1:3,进一步优选为1:1;
优选地,步骤(2)所述升温前的温度为16-25℃,优选为20℃;
优选地,步骤(2)所述升温前的反应时间为5-30min,优选为10-25min, 进一步优选为20min;
优选地,步骤(2)所述升温后的温度为60-78℃,优选为65-75℃,进一步 优选为72℃;
优选地,步骤(2)所述升温后的反应时间为5-30min,优选为10-23min, 进一步优选为15min。
9.一种采用一步法进行DNA末端修复/加dA的试剂盒,其特征在于,所 述试剂盒包含如权利要求3-6中任一项所述的预混液。
10.一种如权利要求1或2所述的方法,或如权利要求3-6中任一项所述 的预混液,或如权利要求9所述的试剂盒在DNA文库制备中的应用。
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