[发明专利]用于检测IL28B基因多态性的探针、基因芯片和试剂盒

说明书

本发明涉及生物技术领域，具体的涉及用于IL28B基因多态性检测的探针、基因芯片和试剂盒。一组用于IL28B基因多态性检测的探针，包括rs12979860和rs8099917位点的探针；所述探针序列为：rs12979860‑C探针：TATTTGTTGGGGTAATCAACTGTT SEQ ID NO.1；rs12979860‑T探针：TATTTGCTGGGGAAACCACTTGTT SEQ ID NO.2；rs8099917‑T探针：CATTTGTTGGGGTAACCAACTATT SEQ ID NO.3；rs8099917‑G探针：TGTTTGCTGGCATAATCAATTATT SEQ ID NO.4。本发明通过特异性的引物和探针的选择，结合基因芯片技术，不仅提高了检测效率和准确度。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体的涉及用于IL28B基因多态性检测的探针、基因芯片和试剂盒。

背景技术

丙型病毒性肝炎是由丙型肝炎病毒(hepatitis C virus，HCV)引起的一种传染病。HCV感染是引起全球慢性肝病的主要原因之一，我国HCV感染率约为3.2％，每年新发丙肝病例约3.5万例。目前，丙型肝炎尚无有效疫苗预防感染。

人IL28B基因位于染色体19q13.13的ACO11445.6基因群上，属于III型干扰素家族，编码IFN-λ3。IL28B基因由6个外显子和5个内显子组成，含有由

22个氨基酸组成的信号肽。研究发现丙型肝炎的治疗与宿主的IL28B基因多态性高度相关。IL28B基因的两个多态性位点rs12979860和rs8099917与丙型肝炎病毒患者的病毒清除有显著的相关性，即与丙肝患者标准化治疗方案(聚乙二醇干扰素联合利巴韦林)的抗病毒治疗效果密切相关。

随着IL28B基因多态性临床诊断价值的出现，市场上有各种检测试剂盒诞生。如基因测序、高分辨率溶解曲线法(high-resolution melting analysis，HRM)、杂交探针法(hybridization probe，HP)、TaqMan探针法、PCR等。其中，基因测序法操作繁琐，工作量大成本高；HRM法操作繁琐，需用测序法对所得结果进一步确认且必须用特殊的仪器设备；HP法成本较高；TaqMan探针法成本高，结果受Taq酶活性影响较大，只能用于少量SNP位点分析，需要特殊的仪器设备，不能发现未知SNP位点；PCR每次只能检测一种突变要多管体系相对应，存在操作不便的缺点。

本发明采用的基因芯片进行检测，其检测通量大，在一张芯片上一次性完成两个位点多态性的检测，结果更准确，具有检测灵敏度高、特异性好，所需样本量少等优点。传统的基因芯片技术的检测，是基于荧光标记探针的荧光发光来进行检测的。其信号弱，必须经过激发，才能发光，需要昂贵的激光扫描设备。在临床检测应用过程中，由于检测单位需要投资购置激光扫描设备，一方面，显著增加了进行相关检测的投资成本，另一方面，也直接增加了应用成本，限制了该技术的市场应用与推广。本发明可通过生物芯片的可见光光学放大，做到了信号分辨率高，信号可以用普通数码相机拍照或肉眼直接判读。相对传统荧光标记具有良好的效果。

发明内容

本发明的目的是为了克服现有技术不足，提供一种快速准确、结果直观的IL28B基因多态性检测的基因芯片和试剂盒。

为解决上述技术问题，本发明的技术方案为：

一组用于IL28B基因多态性检测的探针，包括rs12979860和rs8099917位点的探针；所述探针序列为：

rs12979860-C探针：TATTTGTTGGGGTAATCAACTGTT；

rs12979860-T探针：TATTTGCTGGGGAAACCACTTGTT；

rs8099917-T探针：CATTTGTTGGGGTAACCAACTATT；