[发明专利]用于急性淋巴细胞白血病的预后方法和治疗系统

说明书

相关申请的交叉引用

本申请要求2014年7月30日提交的美国临时专利申请号62/030,629的优权益，其内容通过引用整体并入本文中。

技术领域

本文提供的是用于确定诊断患有急性淋巴细胞白血病(ALL)的患者的预后的方法，并且特别是确定标准治疗后疾病复发风险的方法。本文进一步提供的是治疗的系统，该系统由健康护理提供者指导，并且其包括所描述的预后方法和为被确定为具有特定复发风险的患者推荐的治疗。

背景技术

白血病是一种血液或骨髓的癌症，其特征在于血细胞(通常是白细胞)的异常增加。白血病在临床上和病理上被细分为多种大组，包括其急性形式和慢性形式。急性白血病的特征在于未成熟血细胞的快速增加。这种拥挤使得骨髓不能产生健康的血细胞。由于恶性细胞的快速发展和积累在急性白血病中需要立即治疗，所述恶性细胞然后溢出到血流中并扩散到身体的其他器官。白血病的急性形式是儿童中白血病最常见的形式，其中急性淋巴细胞白血病(ALL)是最普遍的。

目前对ALL的治疗被患者评估和分类引入特定风险组中。这种分类的实例包括柏林-法兰克福-明斯特(Berlin-Frankfurt-Münster)(BFM)、儿童肿瘤学小组(Children’s Oncology Group)(COG)(Schrappe,Ann Hematol.(2004)；83:S121-3；Vrooman LM等人,Curr Opin Pediatr.(2009)；21(1):1-8)、来自英国的UKALL、中国儿童白血病组(Chinese Children’s Leukemia Group)(CCLG)和Dana-Farber癌症研究所ALL联盟(Dana-Farber Cancer Institute ALL Consortium)(DFCI)。在所述分类中，患者特别是在白细胞计数、染色体重排和在治疗开始后第8天对泼尼松治疗的反应性方面进行分类。分类为特定组将确定如何积极地治疗患者以便提供有效治疗并降低疾病复发的可能性。

虽然目前的诊断和治疗方法已将治愈率提高了高达80-90％，但是某些儿童仍然被过度治疗或不足治疗(Schrappe M等人,Leukemia.(2010)；24:253-254；Pui CH和Evans WE,N.Engl.J.Med.(2006)；354:166-178；Bhojwani D等人,Clin.Lymphoma.Myeloma.(2009)；3:S222-230)。此外，目前的预后方法仅确定患者在初始诊断后的几个月的复发风险。因此，存在对可以在更接近治疗开始时对患者分类的更好的ALL预后方法以及由确定的复发风险规定的治疗系统两者的持续需求。

发明内容

本文提供的是通过以下在受试者中急性淋巴细胞白血病(ALL)的预后方法：确定在来自所述受试者的样品(诸如骨髓样品)中miR-1290的表达水平；以及将所述受试者中的miR-1290表达水平与miR-1290的对照表达进行比较，其中与所述对照表达相比，所述受试者中miR-1290表达的显著增加表明所述受试者具有增加的ALL复发的风险；并且其中与对照表达相比，所述受试者中miR-1290表达的显著降低表明所述受试者具有降低的ALL复发的风险。

还提供的是通过以下在受试者中急性淋巴细胞白血病(ALL)的预后方法：确定在来自所述受试者的样品(诸如骨髓样品)中miR-1290的表达水平以及miR-151-5p和miR-451中的至少一种的表达水平；以及将确定的miR-1290以及miR-151-5p和/或miR-451的表达与miR-1290以及miR-151-5p和/或miR-451的对照表达进行比较，其中与所述对照miR-1290表达相比在所述受试者中miR-1290表达的显著增加，和与所述miR-151-5p和/或miR-451的对照表达相比miR-151-5p和miR-451中的至少一种的表达的显著降低结合，表明受试者具有增加的ALL复发的风险；并且其中与所述对照表达相比所述受试者中miR-1290表达的显著降低，和与miR-151-5p和/或miR-451的对照表达相比miR-151-5p和miR-451中的至少一种的表达的显著增加结合，表明所述受试者具有降低的ALL复发的风险。