[发明专利]致肝脓肿肺炎克雷伯菌特异性基因序列及其应用

说明书

本发明提供了致肝脓肿肺炎克雷伯菌特异性基因序列及其应用，本发明提供了致肝脓肿肺炎克雷伯菌特异性基因序列sdm，其序列为SEQ ID NO.1所示。该基因特异性的存在于致肝脓肿肺炎克雷伯菌中，可作为肺炎克雷伯菌肝脓肿的诊断标记物。本发明还提供了针对sdm序列的引物：TTGAATCTTACCCAGAGGAACTT；AACAGCACCTTTCACAACGACAT，该引物可特异性的对sdm序列进行扩增，本发明提供的序列及其引物具有很高的特异性，可以用于肺炎克雷伯菌肝脓肿的诊断，具有商业化开发价值。

技术领域

本发明涉及医学疾病诊断和治疗药物选择领域，具体涉及致肝脓肿肺炎克雷伯菌基因特异性序列及其应用。

背景技术

肺炎克雷伯菌(K.pneumoniae subsp.pneumonia)，属于肠杆菌科细菌，革兰染色阴性，有较厚的荚膜，多数有菌毛，无芽孢和鞭毛，寄生于人体皮肤、鼻咽部和肠道等处，可引起严重的肺炎、尿路感染和血流感染等，是临床上常见的条件致病菌(Li B,Zhao Y,LiuC,Chen Z,Zhou D.Molecular pathogenesis of Klebsiella pneumoniae.FutureMicrobiol,2014；9(9):1071-81)。

肝脓肿(Liver Abscess,LA)是发生于肝脏的一种继发性感染性疾病，可以由细菌、真菌、寄生虫等引起,感染病变中心液化坏死、组织溶解、肉芽组织覆盖并形成脓腔，是常见的消化系统严重疾病。20世纪70年代以前，细菌性肝脓肿主要由以大肠埃希菌为主，当时非手术治疗肝脓肿的死亡率高达83％，手术治疗的死亡率高达28％，促成高死亡率的主要原因是诊断和治疗的不及时(Valles J,C.Leon,Alvarez-Lerma.Nosocomialbacteremia in critically ill patients:a multi-center study evaluatingepidemiology and prognosis.Clin Infe ct Dis,1997,24:387-395)。1986年，台湾Liu等人首次报道了由肺炎克雷伯菌导致的肝脓肿病例7例(Liu Y,Cheng D,Lin C.Klebsiellapneumoniae liver abscess associated with septic endophthalmitis.Arch InternMed 1986；146:1913–16)。随后肺炎克雷伯菌肝脓肿在东亚地区开始流行，包括：中国、新加坡、香港、韩国和越南等。1999年，美国出现肺炎克雷伯菌肝脓肿病例并开始流行(SaccenteM.Klebsiella pneumoniae liver abscess,endoph thalmitis,and meningitis in aman with newly recognized diabetes mellitus.Clin Infect Di s.1999；29(6):1570–1.)；2012年欧洲出现肺炎克雷伯菌肝脓肿病例(Moore R,O'Shea D,Geoghegan T,MallonPW,Sheehan G.Community-acquired Klebsiella pneumoniae liver ab scess:anemerging infection in Ireland and Europe.Infection 2013；41(3):681-6.)；至今，肺炎克雷伯菌肝脓肿遍及全球。随着科技的发展，超声或CT定位下经皮穿刺引流联合高效广谱抗生素是治疗肺炎克雷伯菌肝脓肿的有效方式，但肺炎克雷伯菌肝脓肿病死率仍达4-16％(Wang J,Liu Y,Lee S,Yen M,Chen Y,Wang J,Wann S,Lin H.Primary liver abscess due to Klebsiella pneumoniae in Taiwan.Clin Infect Dis.1998；26:1434–8)。其主要原因为肺炎克雷伯菌肝脓肿不能及时诊断，从而耽误有效治疗。