[发明专利]检测SCA致病基因突变的方法，及其引物、试剂盒

说明书

技术领域

本发明属分子生物学技术领域，涉及检测SCA致病基因突变的方法，及其引物、试剂盒。

背景技术

SCA(Spino-cerebellarataxias)是一种脊髓小脑共济失调疾病，现有的检测SCA的致病基因技术主要是基于单个突变位点的PCR和测序方法及单基因芯片方法，显著缺点主要在于仅仅能检测单个突变位点，不能对多个突变位点进行同时检测，也不能对分布于多个外显子的位点进行同时检测。

发明内容

本发明的目的在于克服上述不足，提供一种检测SCA致病基因突变的方法，其解决了现有技术中进行SCA致病基因突变检测程序繁琐、费用昂贵、费时、易污染和灵敏度低等问题。

为了实现上述目的，本发明采用的技术方案为：一种检测SCA致病基因突变的方法，不用于疾病的诊断和治疗，其特征在于，其包括如下实现步骤：

样本处理：取外周血2ml于EDTA抗凝管中，轻柔地颠倒混匀，4℃保存；

DNA提取，取220μL抗凝血用试剂盒提取DNA，包括：

1)加220μLBufferBL，震荡混合，于70℃孵育10min；

2)加220μL无水乙醇震荡混合约20sec；

3)12000rpm离心1min；

4)取上清转入收集柱中，12000rpm离心2min；

5)将收集柱置一个新的收集管上，加入500μLHBsolution，室温放置5min；

6)12000rpm离心2min；

7)加入700μLwashBuffer，12000rpm离心2min；

8)将收集柱置一个新的收集管上，加入700μLwashBuffer，12000rpm离心2min；

9)弃收集管内液体，12000rpm离心2min；

10)将收集柱放入一个新的1.5ml离心管内，加入50μL70℃预热的洗脱液,室温放置1-2min，12000rpm离心2min，滤液即为模板DNA；

PCR扩增

PCR反应体系：

10×PCRBuffer2μL；

HotStarTaqDNAPolymerase按kit标准调整；

dNTPmix2μL；

上游引物PrimerU1μL；

下游引物PrimerL1μL；

DNA模板xμL；

灭菌蒸馏水20μL---上述总体积；

PCR产物电泳：1.5％琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果；

PCR产物纯化

每管内加入100μLPCR-A液，混匀，转入纯化柱内，12000rpm离心2min；

弃收集管内液体，加入700μLwashingbuffer，12000rpm离心2min；

弃收集管内液体，加入400μLwashingbuffer，12000rpm离心2min；

弃收集管内液体，12000rpm离心2min；

柱内加入30μL70℃预热洗脱液，12000rpm离心3min；

测序反应

反应体系：0.8μLBigDye+1.5μLBigDyeSeqBuffer+3μL引物+1μLPCR纯化产物+3.5μLddH₂O；

测序PCR热循环条件：

1)变性的条件，96℃10sec；

5)退火的条件，(首先96℃10sec，其次50℃5sec，然后60℃4min)×25个循环；

6)延伸的条件，60℃4min；

7)4℃保温；

每一步的时间应从反应混合液达到所要求的温度后开始计算；

测序产物纯化

10μL反应体系，96孔板，酒精/EDTA/NaAc法；

1)每管加入100μL100％酒精，或每管加入1μL125mMEDTA到管底，或每管加入1μL3MNaAc到管底，然后震荡混匀，室温放置15min；

2)10℃，4000rpm离心30min，马上倒置，1200rpm离心1min；

3)每管加入100μL70％酒精，离心15min；5℃，3600rpm离心30min，马上倒置，1200rpm离心1min；

4)室温挥发净酒精，加入10μLHi-DiFormamide溶解DNA；

5)95℃变性5min，4℃保温4min，加样上机；