[发明专利]可检测疾病的生物标志物及其用途

说明书

本发明公开了一种可检测疾病的生物标志物，其至少包含如下的微生物之一或其组合：嗜黏蛋白阿克曼氏菌、脆弱类拟杆菌、鲍氏梭菌、哈氏梭菌、梭菌属、共生梭菌、淤泥真杆菌、发酵乳杆菌、唾液乳杆菌、扭链瘤胃球菌、咽峡炎链球菌、婴儿链球菌、粪便拟杆菌、单形拟杆菌、沃氏嗜胆菌以及Clostridiales sp.SS3/4。本发明还公开了其作为生物标志物用于确定炎症性肠病的用途。本发明进一步公开了检测测定对象中生物标志物的方法、系统及试剂盒。本发明通过对肠道菌群的研究，通过高通量基因测序，筛选出与炎症性肠病相关性高的生物标志物，再利用该标志物准确高效地检测、诊断炎症性肠病，并且进一步用于该疾病的监测治疗效果。

技术领域

本发明涉及生物医药领域，具体地涉及可检测炎症性肠病的生物标志物及其用途。

背景技术

炎症性肠病(IBD)为累及回肠、直肠、结肠的一种特发性肠道炎症性疾病。临床表现腹泻、腹痛，甚至可有血便。本病包括溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD)。溃疡性结肠炎是结肠黏膜层和黏膜下层连续性炎症，疾病通常先累及直肠，逐渐向全结肠蔓延,克罗恩病可累及全消化道，为非连续性全层炎症，最常累及部位为末端回肠、结肠和肛周。

该病因和发病机制尚未完全明确，已知肠道黏膜免疫系统异常反应所导致的炎症反应在IBD发病中起重要作用，认为是由多因素相互作用所致，主要包括环境、遗传、感染和免疫因素。

IBD的发病率正在全世界范围内明显上升，IBD已成为一种全球性疾病。传统观点认为，IBD发病率不仅在人种和地域分布上存在明显差异，而且随时间迁移而产生变化。流行病学研究对深入了解全球范围内IBD的发病率、发病机制与早期诊断等，具有重要推动作用。因此，研究导致炎症性肠病主要病因，并建立强有力和易推广的干预措施，遏制人群中炎症性肠病发病率的上升趋势，已成为中国生物医学、营养学领域中亟待解决的科学问题。

由于炎症性肠病的病理成因较多样化，一般认为是由于先天的遗传因素和后天的环境因素共同作用的。对于这些方面的研究有很多，但都不能很好的解释炎症性肠病的发生以及致病机理。目前，对于炎症性肠病的研究仍在进行中，在实际诊断中，医疗人员往往需要采用多种检测手段、数据，以及专业经验，才能较好的确定病因，耗时长、对医务人员和检测设备资源的占用较多。虽然，部分医务人员或学者提出了一些设想，或进行了一些有益的探索，但是截至到目前，依然尚未有一种较为准确、高效的方法，能够实现快速识别、诊断进而有效地治疗炎症性肠病的目的。

现有文献及技术中，均未有记载通过对肠道菌群的研究，筛选出与炎症性肠病相关性高的生物标志物，利用该标志物正确地诊断炎症性肠病，并且进一步用于监测治疗效果的技术方案。

发明内容

针对现有技术的上述不足，提供一种可检测疾病的生物标志物及其应用，以及检测方法、系统和试剂盒，整体上是通过对被检测对象肠道菌群的研究、并进行基因分离测序，筛选出与炎症性肠病相关性高的生物标志物，利用该标志物正确地诊断炎症性肠病，并且进一步用于监测治疗效果的技术方案。

本发明是基于发明人的下列发现而完成的：先天的遗传因素只能解释不到5％的炎症性肠病患者。现有研究所忽视的一个重要的问题就是肠道微生物。肠道微生物是存在于人体肠道中的微生物群落，是人体的“第二基因组”。人肠道菌群和宿主构成一个相互关联的整体，肠道微生物不仅能降解食物中消化的营养成分、宿主维生素以及其他的一些营养物质，还能促进肠上皮细胞的分化与成熟从而激活肠道免疫系统以及调节宿主能量存储与代谢，这些在人体的消化吸收、免疫反应、代谢活性等方面都发挥着重要的作用。肠道菌群还可以控制动物的脂肪代谢、引发全身性的低度慢性炎症，从而导致炎症性肠病的发生，而且这种致病作用远远大于动物自身基因缺陷对发病的贡献。发明人通过对肠道菌群的研究筛选出与炎症性肠病相关性高的生物标志物，并且利用该标志物能够正确地诊断炎症性肠病，并且可以用于监测治疗效果。

为实现上述目的，本发明提出了含有一组可分离的微生物的标志物，具体提供了如下技术方案：