[发明专利]与辣椒抗黄瓜花叶病毒病基因qcmv-2-1连锁的分子标记及其应用

说明书

技术领域

本发明属于分子育种领域，涉及与辣椒抗黄瓜花叶病毒病基因qcmv-2-1连锁的分子标记及其应用。

背景技术

黄瓜花叶病毒(Cucumbermosaicvirus，CMV)为雀麦花叶病毒科(Bromoviridae)黄瓜花叶病毒属(Cucumovirus)的典型成员，可引起辣椒严重的系统症状，导致叶片黄化、扭曲变形、严重花叶，损害果实的商品性状。黄瓜花叶病毒病一般能导致辣椒减产20％～30％，严重时可达50％～60％，个别地区甚至绝收，是辣椒最严重的病害之一。我国辣椒生产中CMV检出率最高，是辣椒抗病育种的主攻目标。

传统育种方法中，选育抗病材料是通过接种鉴定，根据植株的表型进行筛选。该种方法因为接种不充分或发病条件不适宜而影响选择效率，难以准确、快速的筛选出具有抗病基因的个体植株。此外辣椒抗黄瓜花叶病毒病基因大部分来自野生辣椒，抗病基因常与不良性状基因紧密连锁。利用传统育种方法打破不良连锁所需群体大、周期长、效率低，而分子标记辅助选择(MolecularMarker-assistedSelection，MAS)育种可有效的克服传统育种的缺陷，加速育种进程。

插入/缺失多态性(insertion/deletion,InDel)是由于等位基因位点处的DNA序列在不同个体间发生了核苷酸片段的插入/缺失而产生的长度多态性变异。根据目标位点两侧的序列设计特异引物进行PCR扩增，扩增片段的长度多态性即是InDel标记。在整个基因组中，Indel标记的多态性频率仅次于SNP标记，远高于SSR标记。InDel标记多态性可通过聚合酶链式反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳或非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳等简单的步骤达到基因分型的目的。InDel标记为共显性标记，具有较好的稳定性和较为丰富的多态性，广泛应用于高分辨率图谱构建、关联分析、基因定位和目标性状分子标记筛选等领域。本发明采用QTL-Seq方法和Indel标记技术，筛选与黄瓜花叶病毒病抗性基因qcmv-2-1紧密连锁的标记，以实现黄瓜花叶病毒病抗性的分子标记辅助育种，加速我国辣椒抗黄瓜花叶病毒病新品种的选育进程。

发明内容

本发明的目的是针对现有技术的上述不足，提供一种与辣椒抗黄瓜花叶病毒病基因qcmv-2-1连锁的分子标记。

本发明的另一目的是提供与辣椒黄瓜花叶病毒病抗性基因qcmv-2-1连锁的分子标记的引物对。

本发明的又一目的是提供该分子标记及其引物对的应用。

本发明的目的可通过以下技术方案实现：

一种与辣椒黄瓜花叶病毒病抗性基因qcmv-2-1连锁的分子标记，通过引物对InDel-2-134F/InDel-2-134R扩增辣椒基因组DNA，获得的230bp的扩增片段为所述的与辣椒黄瓜花叶病毒病抗性基因qcmv-2-1连锁的分子标记；其中，InDel-2-134F序列如SEQIDNO.1所示，InDel-2-134R序列如SEQIDNO.2所示。

与辣椒黄瓜花叶病毒病抗性基因qcmv-2-1连锁的分子标记的引物对InDel-2-134F/InDel-2-134R，InDel-2-134F序列如SEQIDNO.1所示，InDel-2-134R序列如SEQIDNO.2所示。

辣椒黄瓜花叶病毒病抗性基因qcmv-2-1的分子标记方法，用本发明所述的引物对InDel-2-134F/InDel-2-134RPCR扩增待检辣椒基因组DNA，并检测扩增产物，如果扩增出230bp的扩增片段，则标志着待检辣椒中存在辣椒抗黄瓜花叶病毒病基因qcmv-2-1，待检辣椒为黄瓜花叶病毒病抗病植株。

本发明所述的分子标记在鉴定辣椒种质资源中黄瓜花叶病毒病抗性基因qcmv-2-1中的应用。

本发明所述的分子标记在筛选抗黄瓜花叶病毒病的辣椒中的应用。

本发明所述的分子标记在培育抗黄瓜花叶病毒病辣椒的分子育种中的应用。

本发明所述的引物对InDel-2-134F/InDel-2-134R在鉴定辣椒种质资源中黄瓜花叶病毒病抗性基因qcmv-2-1中的应用。

本发明所述的引物对InDel-2-134F/InDel-2-134R在筛选抗黄瓜花叶病毒病辣椒中的应用。

本发明所述的引物对InDel-2-134F/InDel-2-134R在培育抗黄瓜花叶病毒病辣椒的分子育种中的应用。