[发明专利]一种毒沟褶菌的DNA条形码标准基因及其应用在审

专利信息
申请号: 201510568850.6 申请日: 2015-09-09
公开(公告)号: CN105238795A 公开(公告)日: 2016-01-13
发明(设计)人: 张颖;米飞;徐建平;余泽芬;张克勤 申请(专利权)人: 云南大学
主分类号: C12N15/31 分类号: C12N15/31;C12Q1/68;C12Q1/04
代理公司: 昆明科阳知识产权代理事务所 53111 代理人: 董建国
地址: 650091*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 一种 毒沟褶菌 dna 条形码 标准 基因 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种毒沟褶菌的DNA条形码标准基因,其特征在于,条形码标准基因序列SEQIDNO.1:

TCTTGTTCTTAGTGGAGCGAGGATCGGTTCAACGAAATTGTTAAGGAAACATCTACTTTCATCAAAAAGGTCGGATACAACCCCAAGGCCGTCGCTTTCGTTCCCATCTCTGGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGAATCTACCAAGTAAGTCTTTAATGGCYGAGCCATATCATGGTTTTGATAATCGCTATCTTAGCATGTCATGGTTCAAGGGCTGGACCAAGGAGACGAAGGCCGGTGTTGTCAAGGGCAAGACCCTTCTMGATGCTATTGACGCCATTGAACCCCCTGTGCGTCCTTCCGACAAGCCCCTCCGTCTTCCCCTTCAGGATGTCTACAAAATCGGTGGTATCGGTACTGTCCCTGTCGGTCGTGTTGAAACCGGTATCATCAAGGCCGGCATGATTGTCACTTTCGCCCCTTCAAATGTCACCACTGAAGTCAAGTCGGTCGAAATGCACCACGAGCAGCTTGAGCAAGGAACCCCTGGTGATAACGTCGGTTTCAACGTCAAGTATGTGTACTTTCCGTTCCCCTTCACCGAATCTCACTTTGTGTCAGAAACGTCTCCGTCAAGGATATTCGTCGTGGTAATGTCGCCTCCGATTCGAAGAACGACCCCTGC。

2.一种应用权利要求1所述的标准基因进行毒沟褶菌分子鉴定的方法,其特征在于,包括以下4个步骤:

(1)从样品组织中提取基因组DNA;

(2)以步骤(1)所提取的基因组DNA为模板,用毒沟褶菌TEF特异性引物,进行聚合酶链式反应;

(3)对步骤(2)扩增得到的DNA产物进行测序;

(4)将测序结果与基因序列SEQIDNO.1的进行同源性比对,若同源性在99%以上,即可将该样品鉴定为毒沟褶菌(T.venenata)。

3.根据权利要求2所述的一种应用标准基因进行毒沟褶菌分子鉴定的方法,其特征在于,所述TEF特异性引物的引物序列为:

正向引物TEF-630F:5'CTTGTTCTAGTGGAGCGAGGAT3';

反向引物TEF-630R:5'TTGGCAGGGTCGTTCTTC3'。

4.根据权利要求2所述的一种标准基因进行毒沟褶菌分子鉴定的方法,其特征在于,聚合酶链式反应中,其扩增条件为95℃预变性3min,接下来94℃变性30s,50℃退火1min,72℃延伸1.5min,一共进行30-35个循环,最后72℃延伸10min。

5.根据权利要求2所述的标准基因进行毒沟褶菌分子鉴定的方法,其特征在于,所述DNA产物的长度为630bp。

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