[发明专利]一种毒沟褶菌的DNA条形码标准基因及其应用在审
申请号: | 201510568850.6 | 申请日: | 2015-09-09 |
公开(公告)号: | CN105238795A | 公开(公告)日: | 2016-01-13 |
发明(设计)人: | 张颖;米飞;徐建平;余泽芬;张克勤 | 申请(专利权)人: | 云南大学 |
主分类号: | C12N15/31 | 分类号: | C12N15/31;C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 昆明科阳知识产权代理事务所 53111 | 代理人: | 董建国 |
地址: | 650091*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 毒沟褶菌 dna 条形码 标准 基因 及其 应用 | ||
1.一种毒沟褶菌的DNA条形码标准基因,其特征在于,条形码标准基因序列SEQIDNO.1:
TCTTGTTCTTAGTGGAGCGAGGATCGGTTCAACGAAATTGTTAAGGAAACATCTACTTTCATCAAAAAGGTCGGATACAACCCCAAGGCCGTCGCTTTCGTTCCCATCTCTGGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGAATCTACCAAGTAAGTCTTTAATGGCYGAGCCATATCATGGTTTTGATAATCGCTATCTTAGCATGTCATGGTTCAAGGGCTGGACCAAGGAGACGAAGGCCGGTGTTGTCAAGGGCAAGACCCTTCTMGATGCTATTGACGCCATTGAACCCCCTGTGCGTCCTTCCGACAAGCCCCTCCGTCTTCCCCTTCAGGATGTCTACAAAATCGGTGGTATCGGTACTGTCCCTGTCGGTCGTGTTGAAACCGGTATCATCAAGGCCGGCATGATTGTCACTTTCGCCCCTTCAAATGTCACCACTGAAGTCAAGTCGGTCGAAATGCACCACGAGCAGCTTGAGCAAGGAACCCCTGGTGATAACGTCGGTTTCAACGTCAAGTATGTGTACTTTCCGTTCCCCTTCACCGAATCTCACTTTGTGTCAGAAACGTCTCCGTCAAGGATATTCGTCGTGGTAATGTCGCCTCCGATTCGAAGAACGACCCCTGC。
2.一种应用权利要求1所述的标准基因进行毒沟褶菌分子鉴定的方法,其特征在于,包括以下4个步骤:
(1)从样品组织中提取基因组DNA;
(2)以步骤(1)所提取的基因组DNA为模板,用毒沟褶菌TEF特异性引物,进行聚合酶链式反应;
(3)对步骤(2)扩增得到的DNA产物进行测序;
(4)将测序结果与基因序列SEQIDNO.1的进行同源性比对,若同源性在99%以上,即可将该样品鉴定为毒沟褶菌(T.venenata)。
3.根据权利要求2所述的一种应用标准基因进行毒沟褶菌分子鉴定的方法,其特征在于,所述TEF特异性引物的引物序列为:
正向引物TEF-630F:5'CTTGTTCTAGTGGAGCGAGGAT3';
反向引物TEF-630R:5'TTGGCAGGGTCGTTCTTC3'。
4.根据权利要求2所述的一种标准基因进行毒沟褶菌分子鉴定的方法,其特征在于,聚合酶链式反应中,其扩增条件为95℃预变性3min,接下来94℃变性30s,50℃退火1min,72℃延伸1.5min,一共进行30-35个循环,最后72℃延伸10min。
5.根据权利要求2所述的标准基因进行毒沟褶菌分子鉴定的方法,其特征在于,所述DNA产物的长度为630bp。
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