[发明专利]用于筛查脊髓性肌萎缩症致病基因携带者的试剂盒及应用在审
申请号: | 201510362673.6 | 申请日: | 2015-06-26 |
公开(公告)号: | CN105039318A | 公开(公告)日: | 2015-11-11 |
发明(设计)人: | 周德富;陈瑛 | 申请(专利权)人: | 苏州市职业大学;陈瑛 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68;C12N15/10 |
代理公司: | 南京利丰知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32256 | 代理人: | 王锋 |
地址: | 215000 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 脊髓 萎缩 致病 基因 携带者 试剂盒 应用 | ||
1.一种用于筛查脊髓性肌萎缩症致病基因携带者的试剂盒,其特征在于包括:
以SMN1基因exon7为检测对象而设计的PCR扩增引物和第一Taqman探针,
以及,PCR反应试剂,包括聚合酶及缓冲溶液;
其中,所述PCR扩增引物具有:
SEQIDNo.1、SEQIDNo.2所示序列,
或者,相对于SEQIDNo.1、SEQIDNo.2的核酸序列有一个碱基缺失、替代或插入且保留与SEQIDNo.1、SEQIDNo.2相同生物活性的核酸序列;
所述第一Taqman探针具有:
SEQIDNo.3所示序列;
或者,相对于SEQIDNo.3的核酸序列有一个碱基缺失、替代或插入且保留与SEQIDNo.3相同生物活性的核酸序列。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于还包括以ALB基因exon12为检测对象而设计的内参引物和第二Taqman探针,所述内参引物具有SEQIDNo.4、SEQIDNo.5所示序列,所述第二Taqman探针具有SEQIDNo.6所示序列。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于所述第一Taqman探针的至少一端还连接有荧光基团。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于所述第一Taqman探针一端连接有荧光基团,另一端连接有淬灭基团。
5.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于所述第二Taqman探针的至少一端还连接有荧光基团。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于所述第二Taqman探针一端连接有荧光基团,另一端连接有淬灭基团。
7.根据权利要求4或6所述的试剂盒,其特征在于所述荧光基团包括FAM、TET或VIC,所述淬灭基团包括MGBNFQ。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的试剂盒,其特征在于所述PCR反应试剂包括TaqMan通用PCR扩增预混试剂。
9.一种采用权利要求1-8中任一项所述的试剂盒筛查脊髓性肌萎缩症致病基因携带者的PCR扩增方法,其特征在于包括:
将受检样本与所述SMN1基因exon7和内参ALB基因exon12的PCR扩增引物、第一Taqman探针、第二Taqman探针PCR反应试剂混合形成PCR反应体系,
进行PCR扩增反应,包括:
变性反应,条件包括:温度为95℃-97℃,时间为5min-10min;
PCR循环扩增反应,条件包括:退火和延伸温度为58℃-61℃,40个循环;
以及,检测SMN1基因exon7拷贝数,从而判别所述基因样本是否来源于脊髓性肌萎缩症基因携带者。
10.根据权利要求9所述的PCR扩增方法,其特征在于:当SMN1基因exon7拷贝数为2时,受检样本为非脊髓性肌萎缩症致病基因携带者,拷贝数为1时,受检样本为脊髓性肌萎缩症致病基因携带者,拷贝数为0时,为脊髓性肌萎缩症患者;拷贝数为3时,受检样本为非脊髓性肌萎缩症致病基因携带者。
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