[发明专利]一种海洋环境α变形菌群落检测基因芯片及其应用

说明书

技术领域

本发明属于分子检测技术领域，具体涉及一种海洋环境α变形菌群落检测基因芯片及应用，本发明的芯片能识别海洋环境中不同科的α变形菌。

背景技术

海洋环境检测是是保护海洋生态环境可持续健康发展的重要环节。海洋环境监测包括化学监测和生物监测。生物监测主要是对海洋环境中的浮游生物、底栖生物、海草、红树植物、珊瑚、大肠杆菌等生物种类组成和数量分布进行监测，缺少对海洋细菌群落的监测。细菌作为一类多样性最高的生命形式，在海洋环境中承担着重要的生态功能(碳循环，氮循环，硫循环，磷循环和金属循环等)。细菌复杂的群落结构、功能、相互作用和动态变化对海洋生态功能的维持有着重要意义。因此，增加对海洋环境各个细菌种类组成和数量分布的监测，对建立、健全近岸海域海洋环境质量综合评价体系来说十分必要。

目前针对海洋大肠杆菌的监测主要是利用传统的分离培养方法。这种监测方法繁琐、耗时、耗力，不适合对多种细菌同时进行监测。亟需发展高通量、高效、便捷的海洋细菌群落监测技术。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是提供一种检测海洋环境α变形菌群落的基因芯片及应用，即可平行、快速、高通量的检测海洋环境α变形菌群落，使基因芯片技术更好的应用于海洋环境监测，从而弥补现有技术的不足。

本发明的基因芯片，包括有芯片载体，以及固定在芯片载体上的，用于检测海水中Acetobacteraceae、Beijerinckiaceae、Bradyrhizobiaceae、Brucellaceae、Caulobacteraceae、Cohaesibacteraceae、Erythrobacteraceae、Hyphomicrobiaceae、Hyphomonadaceae、Kordiimonadaceae、Methylobacteriaceae、Methylocystaceae、Parvularculaceae、Phyllobacteriaceae、Rhizobiaceae、Rhodobacteraceae、Rhodobiaceae、rhodospirillaceae、Rickettsiaceae、Sneathiellaceae、Sphingomonadaceae、Xanthobacteraceae的探针；

其中用于检测Acetobacteraceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:1-2中的任一种或几种；

用于检测Beijerinckiaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:3-5中的任一种或几种；

用于检测Bradyrhizobiaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:6-8中的任一种或几种；

用于检测Brucellaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:9-10中的任一种或几种；

用于检测Caulobacteraceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:11-13中的任一种或几种；

用于检测Cohaesibacteraceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:14-15中的任一种或几种；

用于检测Erythrobacteraceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:16-17中的任一种或几种；

用于检测Hyphomicrobiaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:18-20中的任一种或几种；

用于检测Hyphomonadaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:21-23中的任一种或几种；

用于检测Kordiimonadaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:24-26中的任一种或几种；

其中，用于检测Methylobacteriaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:27-29中的任一种或几种；

用于检测Methylocystaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:30-31中的任一种或几种；

用于检测Parvularculaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:32-33中的任一种或几种；