[发明专利]使用靶基因表达的数学建模评价PI3K细胞信号传导途径活性

权利要求书

1.一种方法，其包括：

至少基于医学主体的组织和/或细胞和/或体液的提取样品中测量的PI3K细胞信号传 导途径的一种或多种靶基因的表达水平推断所述医学主体的组织和/或细胞和/或体液中 的PI3K细胞信号传导途径的活性，其中所述推断包括：

测定所述医学主体的组织和/或细胞和/或体液的提取样品中的FOXO转录因子（TF）元 件的水平，所述FOXOTF元件控制PI3K细胞信号传导途径的一种或多种靶基因的转录，所述 测定至少部分基于评估将PI3K细胞信号传导途径的一种或多种靶基因的表达水平与FOXO TF元件的水平关联的数学模型；

基于所述医学主体的组织和/或细胞和/或体液的提取样品中的FOXOTF元件的测定水 平推断所述医学主体的组织和/或细胞和/或体液中的PI3K细胞信号传导途径的活性，

其中所述推断通过使用所述数学模型的数字处理设备来执行。

2.权利要求1的方法，其中所述推断包括：

至少基于所述医学主体的组织和/或细胞和/或体液的提取样品中测量的PI3K细胞信 号传导途径的一种或多种、优选至少三种靶基因的表达水平推断所述医学主体的组织和/ 或细胞和/或体液中的PI3K细胞信号传导途径的活性，所述靶基因选自：AGRP、BCL2L11、 BCL6、BNIP3、BTG1、CAT、CAV1、CCND1、CCND2、CCNG2、CDKN1A、CDKN1B、ESR1、FASLG、FBXO32、 GADD45A、INSR、MXI1、NOS3、PCK1、POMC、PPARGC1A、PRDX3、RBL2、SOD2和TNFSF10。

3.权利要求2的方法，其中所述推断还基于医学主体的组织和/或细胞和/或体液的提 取样品中测量的PI3K细胞信号传导途径的至少一种靶基因的表达水平，所述靶基因选自： ATP8A1、C10orf10、CBLB、DDB1、DYRK2、ERBB3、EREG、EXT1、FGFR2、IGF1R、IGFBP1、IGFBP3、 LGMN、PPM1D、SEMA3C、SEPP1、SESN1、SLC5A3、SMAD4和TLE4。

4.权利要求2的方法，其中所述推断还基于医学主体的组织和/或细胞和/或体液的提 取样品中测量的PI3K细胞信号传导途径的至少一种靶基因的表达水平，所述靶基因选自： ATG14、BIRC5、IGFBP1、KLF2、KLF4、MYOD1、PDK4、RAG1、RAG2、SESN1、SIRT1、STK11和TXNIP。

5.权利要求1的方法，其还包括：

基于所述医学主体的组织和/或细胞和/或体液中的PI3K细胞信号传导途径的推断活 性确定PI3K细胞信号传导途径在所述医学主体的组织和/或细胞和/或体液中是否异常运 行。

6.权利要求5的方法，其还包括：

为所述医学主体推荐开药，所述药物校正PI3K细胞信号传导途径的异常运行；

其中只有当基于PI3K细胞信号传导途径的推断活性确定PI3K细胞信号传导途径在所 述医学主体的组织和/或细胞和/或体液中异常运行时才进行所述推荐。