[发明专利]一种基于恒温指数扩增反应与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法及其应用在审
| 申请号: | 201410491409.8 | 申请日: | 2014-09-23 |
| 公开(公告)号: | CN104278088A | 公开(公告)日: | 2015-01-14 |
| 发明(设计)人: | 张春阳;叶丽平;胡娟 | 申请(专利权)人: | 深圳先进技术研究院 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/65 |
| 代理公司: | 广州三环专利代理有限公司 44202 | 代理人: | 郝传鑫;熊永强 |
| 地址: | 518055 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 恒温 指数 扩增 反应 表面 增强 光谱 检测 mirna 方法 及其 应用 | ||
1.一种基于恒温指数扩增与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)提供或配置恒温指数扩增反应体系,扩增待测miRNA,通过恒温指数扩增反应扩增待测miRNA,得到扩增产物,其中,所述恒温指数扩增反应体系中包括待测样品和扩增模板;
2)制备金属纳米颗粒,然后采用巯基修饰的捕获探针对所述金属纳米颗粒进行标记,得到捕获探针-金属纳米颗粒复合物;
3)提供报告分子修饰的报告探针;
4)将步骤(1)所得的扩增产物、步骤(2)所得的捕获探针-金属纳米颗粒复合物、以及步骤(3)所述的报告探针进行混合,得到反应液,所述反应液在55~95℃下孵育2~10分钟后,自然冷却到室温,离心、洗涤、去上清,再将沉淀转移到硅片上,自然晾干后进行SERS检测;
其中,步骤(1)所述的扩增模板、步骤(2)所述的捕获探针、步骤(3)所述的报告探针均为单链脱氧核糖核苷酸,所述捕获探针和报告探针互不相同,且不互补;
所述步骤(1)中,所述扩增模板包括X序列和T序列,所述X序列和T序列之间具有切刻内切酶的识别序列;所述X序列与待测miRNA互补,所述T序列包括C序列和R序列,所述C序列为捕获探针的核苷酸序列,所述R序列为报告探针的序列。
2.如权利要求1所述的基于恒温指数扩增与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中,所述恒温指数扩增反应体系中,采用的DNA聚合酶为Phi29DNA聚合酶、Bst DNA聚合酶大片段、VentR exo–DNA聚合酶或Klenow片段聚合酶。
3.如权利要求1所述的基于恒温指数扩增与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中,所述切刻内切酶为Nt.BspQI、Nb.BsmI、Nt.AlwI、Nt.BbvCI或Nt.BstNBI切刻酶。
4.如权利要求1所述的基于恒温指数扩增与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中,所述恒温指数扩增反应采用的时间为10~60分钟。
5.权利要求1所述的基于恒温指数扩增与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中,所述恒温指数扩增反应体系中,采用的DNA聚合酶的浓度为0.03~0.08U/ul。
6.如权利要求1所述基于恒温指数扩增与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中,所述恒温指数扩增反应体系中,采用的切刻内切酶的浓度为0.2~0.6U/ul。
7.如权利要求1所述的基于恒温指数扩增与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中,所述扩增模板中的T序列至少重复1次。
8.如权利要求1所述的基于恒温指数扩增与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法,其特征在于,所述步骤(2)中,所述金属纳米颗粒的大小为12~100nm。
9.如权利要求1所述的基于恒温指数扩增与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中,所述报告分子为染料分子。
10.如权利要求1所述的基于恒温指数扩增与表面增强拉曼光谱检测的miRNA检测方法在制备miRNA检测试剂盒中的应用。
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