[发明专利]与大豆抗疫病基因RpsZS18共分离的分子标记及其应用

说明书

本发明提供一种与大豆抗疫病基因RpsZS18共分离的分子标记ZCindel246000及其应用，所述标记位于大豆2号染色体的SSR标记ZCSSR33和ZCSSR46之间，且与基因RpsZS18的遗传距离为0cM。本发明以抗病品种早熟18为父本，感病品种Williams为母本，通过杂交和自交产生F₃群体作为作图群体，根据初定位结果，用该区间内公布的大豆SSR标记和利用大豆基因组序列开发新的SSR标记，对早熟18含有的抗病基因进行精细定位。抗病基因RpsZS18被定位在2号染色体的ZCSSR33(0.7cM)和ZCSSR46(2.8cM)之间，并与SSR标记Satt172共分离。根据新定位区间内的基因注释，预测RpsZS18候选基因，根据抗、感亲本预测的候选基因位点序列差异，开发Indel标记ZCindel24600，将该标记进行群体验证后发现其为共分离标记，该Indel标记可用于大豆抗疫病的辅助育种中。

技术领域

本发明属于农业生物技术工程和农作物抗病遗传育种领域，具体地说，涉及一种与大豆抗疫病基因RpsZS18共分离的分子标记及其应用。

背景技术

由大豆疫霉(Phytophthora sojae Kaufmann&Gerdemann)引起的大豆疫病是大豆生产中的一种毁灭性病害。该病已在我国黑龙江省、安徽、福建、吉林、新疆等省份发生。大豆疫霉在大豆所有生育期均可以侵染大豆，引起根腐、茎腐、植株矮化、枯萎和死亡，一般田块减产10-30％，严重地块可达60-90％，甚至造成绝产。目前全世界每年因大豆疫霉病造成的经济损失大约为10亿美元(Tyler,2007)。

防治大豆疫病最为经济、有效且环境安全的方法是种植抗病品种。目前，国外已经在大豆基因组上的8个基因座上鉴定了17个抗性基因。分别为Rps1(Bernard et al.,1957)、Rps2(Kilen et al.,1974)、Rps3 (Mueller et al.,1978)、Rps4(Athow et al.,1980)、Rps5(Buzzell和 Anderson.,1981)、Rps6(Athow和Laviolette.,1982)、Rps7(Anderson和 Buzzell.,1992)、Rps8(Gordon et al.,2006；Sandhu et al.,2005)、大豆品种Waseshiroge的Rps gene(Sugimoto et al.,2011)、RpsUN1和 RpsUN2(Lin et al.,2013)。在Rps1位点上共有5个等位基因(Rps1a,1b, 1c,1d,1k)(Bernard et al.,1957；Buzzell和Anderson,1992；Mueller et al., 1978)，在Rps3位点上共有3个等位基因(Rps3a,3b和3c)(Mueller et al., 1978；Ploper et al.,1985)。Rps1、Rps7、Waseshiroge的Rps gene和 RpsUN1被定位在3号染色体上；Rps2和RpsUN2被定位在第16号染色体上。Rps3和Rps8被定位在第13号染色体上；Rps4、Rps5和Rps6被定位在第18号染色体上。

迄今，我国已经鉴定了9个大豆抗疫病基因，即RpsYB30、 RpsYD25、RpsZS18、RpsSN10、Rps9、RpsSu、RpsYD29、Rps10和RpsJS。抗病基因RpsYB30被定位在了大豆第19号染色体(朱振东，2007)。 RpsYD25被定位大豆第3号染色体(范爱颖等,2009)；RpsZS18被定位在了大豆第2号染色体上(姚海燕，2010)；RpsSN10被定位于大豆第 13号染色体上(于安亮,2010)；Rps9被定位在大豆第3号染色体上(Wu et al.,2011)。RpsSu被定位在了大豆第10号染色体上(武晓玲等, 2011)。RpsYD29被定位在第3号染色体(Zhang et al.,2013a)。Rps10被定位在大豆第17号染色体上(Zhang et al.,2013b)。最新发现的 RpsJS定位在18号染色体上(Sun et al.，2013)。