[发明专利]一种与乳腺癌辅助诊断相关的SNP标志物及其应用

说明书

技术领域

本发明属于基因工程及肿瘤学领域，涉及一种乳腺癌辅助诊断相关的SNP标志物及其应用。

背景技术

乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤，严重威胁女性健康。据统计，2012年全球有168万乳腺癌新发病例，约占女性所有恶性肿瘤新发病例的25.2％。我国乳腺癌的发病率虽低于西方发达国家，但近二十年来，其仍以每年3-5％的速度递增，远高于0.5％的世界平均增长水平。虽然乳腺癌的预后较好，但是由于其高发病率，仍然是女性恶性肿瘤死亡的首要原因。2012年，我国因乳腺癌死亡的女性达4.8万人。因此，乳腺癌已成为威胁我国女性健康的首要恶性肿瘤，是亟待解决的重大公共卫生问题。

目前，对乳腺癌的一级预防(病因预防)尚无明确、有效的预防措施，但是若能加强二级预防工作，如早期发现、早期诊断、早期治疗，预后一般较好，能降低乳腺癌死亡率，提高患者生活质量。因此，争取早期诊断是乳腺癌防治的一项基本策略。目前早期诊断乳腺癌的方式主要有乳腺增生患者的定期筛查、乳腺的自我检查、乳腺影像学检查(乳腺钼靶X线摄影、乳腺彩色多谱勒超声检查、CT和磁共振等)以及乳腺癌的病理检查(细胞学穿刺检查和组织学检查)。虽然乳腺癌的早期检测手段在不断进步发展，但是真正有较好应用前景的早期诊断方法尚有限，有些早期患者肿块较小、边界清楚且活动性好，不易与良性肿瘤相鉴别。一些年轻女性对乳腺检查不够重视并且存在一定的抗拒心理，也会阻碍乳腺癌的早期诊断。一旦延误病情，发展至晚期，其预后往往较差。因此，亟需寻找更加明确而有效的生物标志物用于乳腺癌的早期明确诊断，实现患者早期治疗，从而切实提高乳腺癌的预后。

研究表明，除了月经生育史以及一些其他环境暴露因素外，遗传因素是引发乳腺癌的主要原因。其中，单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms，SNP)发挥了重要作用。SNP是指单个核苷酸的改变而引起的DNA序列的改变，它是人类最常见的可遗传变异，在人类基因组中广泛存在。SNP赋予个体对环境暴露、药物治疗等的不同反应，从而产生不同的表型，因此SNP可能是导致个体疾病发生发展差异的重要遗传基础。利用疾病易感的SNP谱诊断疾病，具有快速、灵敏、准确等特点，因而应用前景广阔。近年来，利用SNP诊断疾病的发生发展已成为临床和科研工作者的研究热点。

然而，目前还没有将SNP应用于乳腺癌诊断的报道，若能筛选出乳腺癌易感的SNP作为生物标志物，并研制相应的诊断试剂盒，必将有力地推动我国乳腺癌早期诊断的现状，并为其药物筛选、药效评价及靶向治疗开辟新的途径。

发明内容

本发明的目的是针对上述技术问题，提出一种与乳腺癌辅助诊断相关的SNP标志物。

本发明的第二个目的是提供上述SNP标志物的特异性扩增引物。

本发明的第三个目的是提供上述SNP标志物的特异性延伸引物。

本发明的第四个目的是提供上述SNP标志物及其特异性扩增引物和特异性延伸引物在制备乳腺癌辅助诊断试剂盒中的应用。

本发明的第五个目的是提供乳腺癌辅助诊断试剂盒。

发明人通过分离和研究乳腺癌患者及与其年龄匹配的健康女性对照外周血DNA中的单核苷酸多态性，寻找一组与乳腺癌高度相关的高特异性和敏感性的SNP，并研制出可便于临床应用的乳腺癌辅助诊断试剂盒，为乳腺癌的筛查和诊断提供数据支持。

本发明的目的是通过下列技术方案实现的：

一种与乳腺癌辅助诊断相关的SNP标志物，该标志物为rs10152591、rs1037699、rs10487075、rs11645106、rs11663688、rs11768670、rs11910707、rs12972670、rs13038095、rs142255517、rs142895740、rs144600021、rs17128116、rs2053026、rs213212、rs2229300、rs2981582、rs35002951、rs3748140、rs3757318、rs498114、rs549652、rs6433379、rs6932260、rs7833986、rs8190955、rs871545、rs905799、rs925946、rs9397426、rs9469578和rs9650315的组合。

所述的SNP标志物的特异性扩增引物，这些引物为：