[发明专利]基于分子结构预测有机化合物的牛血清白蛋白‑水分配系数的方法及模型建立方法有效

专利信息
申请号: 201410251455.0 申请日: 2014-09-26
公开(公告)号: CN104200056B 公开(公告)日: 2017-06-06
发明(设计)人: 于海瀛;陈伟;郭婷 申请(专利权)人: 浙江师范大学
主分类号: G06F19/16 分类号: G06F19/16;G06F19/18;G06F19/12
代理公司: 杭州丰禾专利事务所有限公司33214 代理人: 王从友
地址: 321004 *** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 基于 分子结构 预测 有机化合物 血清 白蛋白 水分 系数 方法 模型 建立
【权利要求书】:

1.基于分子结构预测有机化合物的牛血清白蛋白-水分配系数的方法,其特征在于该方法采用以下的模型进行牛血清白蛋白-水分配系数预测:

logKBSA/W = 0.747×logKow + 0.476×EHOMO - 0.024×CCR + 0.870×q+ + 0.007×CSEV + 4.342;

其中,logKow 表示正辛醇-水分配系数,EHOMO表示最高占据分子轨道能,CCR表示核-核排斥能, q+表示最正净电荷,CSEV 表示Connolly溶剂排斥体积;

所述的模型建立的方法包括以下的步骤:

1) 首先,选择了来自于同一个实验室使用相同方法测定的logKBSA/W值;整个数据集共包括75个中性有机化合物,logKBSA/W的数值范围为1.19~4.76,跨越3.6个数量级;

2) 根据化合物在BSA和水相之间分配机理的分析,共选择21种分子结构描述符用于模型的构建;所述的21种分子结构描述符分别为平均分子极化率α、偶极矩μμ2、标准生成热ΔHf、总能量TE、电子能EE、核-核排斥能CCR、最低未占据分子轨道能ELUMO、最高占据分子轨道能EHOMO、碳原子最负净电荷qC、氢原子最正净电荷qH+、最负净电荷q、最正净电荷q+、COSMO面积Acosmo、COSMO体积Vcosmo、分子量Mw、Connolly溶剂可及分子表面积CAA、Connolly分子表面积CMA、Connolly溶剂排斥体积CSEV、椭圆度Ov和正辛醇-水分配系数logKow

使用MOPAC2012中的PM6算法对分子结构进行优化并计算平均分子极化率α、偶极矩μμ2、标准生成热ΔHf、总能量TE、电子能EE、核-核排斥能CCR、最低未占据分子轨道能ELUMO、最高占据分子轨道能EHOMO、碳原子最负净电荷qC、氢原子最正净电荷qH+、最负净电荷q、最正净电荷q+、COSMO面积Acosmo和COSMO体积Vcosmo15种量子化学描述符,使用ChemOffice 2010和EPI Suite分别计算分子量Mw、Connolly溶剂可及分子表面积CAA、Connolly分子表面积CMA、Connolly溶剂排斥体积CSEV、椭圆度Ov和正辛醇-水分配系数logKow 6种性质参数;

3) 采用多元线性回归MLR方法中的逐步回归理论建立模型,具体过程由SPSS 17.0执行;使用相关系数的平方r2和均方根误差rms作为统计学指标表征模型的拟合性能,使用预测相关系数的平方q2表征模型的预测性能;

经MLR分析得到的最优模型为:

logKBSA/W = 0.747×logKow + 0.476×EHOMO - 0.024×CCR + 0.870×q+ + 0.007×CSEV + 4.342;

其中,logKow 表示正辛醇-水分配系数,EHOMO表示最高占据分子轨道能,CCR表示核-核排斥能,q+表示最正净电荷,CSEV 表示Connolly溶剂排斥体积。

2.根据权利要求1所述的基于分子结构预测有机化合物的牛血清白蛋白-水分配系数的方法,其特征在于:有机化合物包括烷烃、烯烃、卤代烃、醇、苯酚、醚、酮、苯胺、脂肪胺、硝基化合物、多环芳烃、杂环化合物和苯的衍生物。

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