[发明专利]一种检测白血病干细胞是否存在的试剂盒

说明书

本发明公开了一种检测白血病干细胞是否存在的试剂盒，所述试剂盒通过检测造血干细胞程序即HSCB程序来检查白血病干细胞的存在，所述HSCB程序包含以下基因：HOXB4、BMI1、TEL、AML1、PTEN、IKZF1、MLL、GFI1、TCF3、EBF1、SPI1、IKZF1、DNTT、PAX5、VPREB1、RAG1/2、LEF1和IGLL1。本发明设计的HSCB程序能忠实地反映造血细胞的全转录组，判定造血细胞群的干性特征和分化阶段，如果白血病细胞在HSCB的表现接近正常造血干细胞和/或早期祖细胞，就可以判断LPC的存在，预示病人的预后差。本发明所设计的试剂盒检测方便，准确可靠，可以广泛用于白血病的诊断，检测LPCs是否存在和判断病人的预后。

技术领域

本发明涉及白血病诊断试剂盒，更具体地讲，涉及利用新发现的干细胞程序开发检测白血病干细胞是否存在的试剂盒。

背景技术

现普遍认为白血病复发的主要原因是由于现有的治疗方法无法清除体内的白血病干细胞(leukemic propagating cells,LPCs)，检测LPCs是否存在是判断白血病预后的重要途径。目前只有功能实验(如移植给免疫缺陷小鼠)才能判断LPCs的存在，但是实验要求苛刻、耗时很长，不利于临床应用。目前也没有确实的细胞表面分子可以检测LPCs。

作为干细胞，LPCs有自我更新能力和一定的分化能力，相应地，LPCs一定有干细胞程序(包括自我更新所需程序)。因此本发明根据功能已知的诸基因设计了一个造血干细胞(hematopoietic stem cell,HSC)程序，利用普通的定量PCR技术检测该程序基因在白血病细胞的表达谱，就可以快速准确地判定LPCs是否存在，并因此判断病人的预后。

发明内容

本发明所要解决的第一个技术问题是，提供一种检测白血病干细胞是否存在的试剂盒。

本发明所要解决的第二个技术问题是，提供HSCB程序在制备检测白血病干细胞是否存在的试剂盒中的应用。

为了解决上述第一个技术问题，本发明提供了一种检测白血病干细胞是否存在的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒通过检测造血干细胞程序即HSCB程序来检查白血病干细胞的存在，所述HSCB程序包含以下基因：HOXB4、BMI1、TEL、AML1、PTEN、IKZF1、MLL、GFI1、TCF3、EBF1、SPI1、IKZF1、DNTT、PAX5、VPREB1、RAG1/2、LEF1和IGLL1。

作为一个优选方案，所述试剂盒包含以下引物(SEQ ID NO.1—SEQ ID NO.36)：

HOXB4:正向引物5′-TGAGCACGGTAAACCCCAATTACG-3′；

反向引物5′-AGAGCGCGTGGGCGATCTC-3′；

BMI1:正向引物5′-AGAACTGGAAAGTGACTCTGGG-3′；

反向引物5′-AAATGTGAGGAAACTGTGGATG-3′；

TEL:正向引物5′-TTGAAATGAATGGCAAAGCT-3′；

反向引物5′-AGGGTGGAAGAATGGTGAAA-3′；

AML1:正向引物5′-GCCAGAAGGAAGTCAACCT-3′；

反向引物5′-TGAAAACATCCAGCCAAGA-3′；

PTEN:正向引物5′-TCAGTGGCGGAACTTGCAATCCT-3′；

反向引物5′-ACACACAGGTAACGGCTGAGGGA-3′；

IKZF1:正向引物5′-CTACCTGACCAACCACATCGC-3′；