[发明专利]一种与小麦纹枯病抗性QTL紧密连锁的分子标记及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及小麦育种和分子生物学领域，特别是一种与小麦纹枯病抗性QTL紧密连锁的分子标记及其应用。

背景技术

小麦纹枯病是我国长江中下游麦区和黄淮麦区的小麦重要病害，主要由禾谷丝核菌(RhizoctoniacerealisVanderHoeven)等侵染引起，该病害造成小麦产量损失严重，仅2005年～2009年，我国每年遭受纹枯病为害的麦田面积约670～800万公顷，由此造成的经济损失在数十亿元以上。目前该病害的防治以化学防治为主，由于病害发生部位在小麦茎秆基部，防治不仅需药量大且防治效果易受天气等环境因素影响，化学防治也增加了农本，大规模使用化学药剂势必影响生态环境，培育和使用抗病品种无疑是防治小麦纹枯病最经济和有效的手段。

抗病品种的培育需要有抗性稳定的抗源用于配制杂交组合。近三十年来，我国研究人员对3000余份小麦种质材料进行了纹枯病抗性鉴定，虽筛选到一些抗源，但对这些抗源的抗性遗传规律知之甚少，大部分抗源农艺性差，能在育种中使用的纹枯病抗源仍然缺乏。

国外开展小麦纹枯病抗性的研究报道较少，对小麦纹枯病抗病基因(QTL)定位的报道主要集中在国内，利用牙签嵌入和沟播带菌病麦粒抗性鉴定方法，汤颋等(麦类作物学报,2004,24(4):11-16)采用重组自交系群体ARz/扬麦158，在2D、3B、3D和7D染色体上检测到纹枯病抗性QTL，分别解释纹枯病抗性的8％-14％；张小村等(植物遗传资源学报,2005,6(3):276-279)采用盆栽拌种接种方法鉴定重组自交系群体川35050/山农483的纹枯病抗性，QTL定位结果表明1A染色体存在抗纹枯病QTL，该QTL可解释21.57％的纹枯病抗性，同时检测到4对互作QTL，总贡献率为52.2％；采用鲁麦21/山农0431重组自交系群体，在2B染色体检测到与标记Xgwm526连锁的抗纹枯病QTL。任丽娟等(麦类作物学报,2007,27(3):416-420)利用牙签嵌入和表土接种等方法鉴定重组自交系群体苏麦3号/白免3号的纹枯病抗性，结合基因型资料，在染色体2B、3B、5A、6A和6B上发现抗纹枯病QTL，表型解释率分别为9％-13％；Chen等(TheoreticalandAppliedGenetics,2013,126(11):2865-2878)在1A、2B、3B、4A、5D、6B和7B染色体也发现存在纹枯病抗性QTL。

CI12633是我国引进的含Pm2和Pm6的白粉病抗源，该抗源同时兼抗锈病和散黑穗病，多年抗性鉴定表明，该抗源茎秆坚韧，具有较稳定的纹枯病抗性，可用于品种抗性改良。遗传分析表明，CI12633的纹枯病抗性是由主效基因和微效基因共同控制的数量性状，有利于主效基因的分子定位和分子标记辅助选择(任丽娟等，江苏农业学报,2010,26(6):1156-1161)，我们采用CI12633/扬麦158重组自交系群体对其纹枯病抗性主效QTL进行了定位，在6B、5A染色体上发现表型解释率超过10％的抗纹枯病主效QTL，与6B和5A染色体抗性主效QTL紧密连锁的GWM608、GWM88、WMC727和GWM410.2分子标记已经申请专利(专利号：ZL200710019279.8)，但是CI12633品种2D染色体中与纹枯病抗性主效QTL紧密连锁的分子标记目前仍未见报道。

发明内容

本发明目的是提供一种检测小麦2D染色体中是否存在与小麦品种CI12633的纹枯病抗性主效QTL紧密连锁的分子标记，判断小麦植株是否含有纹枯病抗性主效QTL，从而预测小麦植株的纹枯病抗性，加快抗纹枯病小麦的选择进度，具体步骤如下：

一种与小麦纹枯病抗性QTL紧密连锁的分子标记，用小麦品种CI12633的DNA，以引物对SEQNo：1和SEQNo：2进行PCR扩增，扩增产物在6％聚丙烯酰胺凝胶上电泳分离后，获得大小为145bp的分子标记Xgwm484-145。

本发明中，小麦品种CI12633的DNA是指对CI12633小麦植株的叶片分离获取的DNA，所述6％聚丙烯酰胺凝胶是指100ml聚丙烯酰胺胶溶液中含有5.7g丙烯酰胺和0.3g甲叉双丙烯酰胺。

一种上述与小麦纹枯病抗性QTL紧密连锁的分子标记的应用，将分子标记Xgwm484-145用于小麦品种CI12633及其衍生品种或品系基因型的检测，以判断该品种或品系是否具有纹枯病抗性。