[发明专利]H11亚型禽流感病毒RT-LAMP可视化检测试剂盒有效
申请号: | 201410065912.7 | 申请日: | 2014-02-26 |
公开(公告)号: | CN103820576A | 公开(公告)日: | 2014-05-28 |
发明(设计)人: | 谢芝勋;罗思思;刘加波;庞耀珊;邓显文;谢志勤;谢丽基;范晴 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 530001 广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | h11 禽流感 病毒 rt lamp 可视化 检测 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及H11亚型禽流感病毒RT-LAMP可视化检测试剂盒。
背景技术
禽流感病毒(Avian Influenza Virus,AIV)属于正粘病毒科A型流感病毒属,根据表面糖蛋白血凝素(Hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)的抗原性差异,AIV可进一步分为不同的亚型,目前已鉴别出16种HA亚型(H1~H16)和9种NA(N1~N9)亚型。AIV是一种有囊膜、单股负链、分节段的RNA病毒,基因组分为8个节段,分别编码HA、NA、NP、NS、MP、PA、PB1和PB2蛋白。H11亚型AIV为稀有亚型AIV,对该病的研究相对较少,为了更好地了解H11亚型AIV这个病毒以及构建种毒库,目前,国内外尚未见有该HA亚型AIV的检测方法,因此,建立一种快速、简便和特异的检测方法十分迫切,对该病的诊断具有重要意义。
目前,禽流感病毒常用的检测方法包括病毒鸡胚分离鉴定、普通RT-PCR法、实时荧光定量RT-PCR和酶联免疫吸附法等。病毒鸡胚分离鉴定是检测的金标准,先接种鸡胚增殖病毒,再用血凝试验和血凝抑制试验进行鉴定,该法在实验室的检测最为常见,但耗时太长,常需要两天到一周的时间;普通RT-PCR法和实时荧光定量RT-PCR法快速、灵敏,但仪器相对昂贵,并需技术人员进行操作,不适合在基层推广使用;酶联免疫吸附法快速但需要特殊试剂;这些方法在实际应用上存在一定的局限性。
环介导等温扩增方法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)最早由日本Notomi等报道,是一种新型核酸扩增技术,与其它方法相比,LAMP具有更方便、更简捷、更灵敏和结果可视化等优点,目前在一些病原微生物的检测中被广泛运用。
发明内容
本发明的一个目的是提供一种检测H11亚型禽流感病毒的环介导等温扩增引物组。
本发明所提供的检测H11亚型禽流感病毒的环介导等温扩增引物组,具体为如下引物组A或引物组B:
所述引物组A由引物1、引物2、引物3、引物4、引物5和引物6组成;所述引物组B由所述引物1、所述引物2、所述引物3和所述引物4组成。
所述引物1(内引物FIP-H11)、所述引物2(内引物BIP-H11)、所述引物3(外引物F3-H11)、所述引物4(外引物B3-H11)、所述引物5(环引物LF-H11)和所述引物6(环引物LB-H11)的核苷酸序列分别为序列表中的序列1、序列2、序列3、序列4、序列5和序列6。
所述引物组A中,所述引物1、所述引物2、所述引物3、所述引物4、所述引物5和所述引物6的摩尔比具体可为8:8:1:1:4:4;所述引物组B中,所述引物1、所述引物2、所述引物3和所述引物4的摩尔比具体可为8:8:1:1。
在本发明的一个实施例中,所述引物1(内引物FIP-H11)和所述引物2(内引物BIP-H11)在环介导等温扩增反应体系中的终浓度均为1.6μM,所述引物3(外引物F3-H11)和所述引物4(外引物B3-H11)在环介导等温扩增反应体系中的终浓度均为0.2μM,、所述引物5(环引物LF-H11)和所述引物6(环引物LB-H11)在环介导等温扩增反应体系中的终浓度均为0.8μM。
序列1由42个核苷酸组成,序列2由41个核苷酸组成,序列3由20个核苷酸组成,序列4由22个核苷酸组成,序列5由20个核苷酸组成,序列6由19个核苷酸组成。
本发明的第二个目的是提供一种检测H11亚型禽流感病毒的逆转录环介导等温扩增试剂。
本发明所提供的检测H11亚型禽流感病毒的逆转录环介导等温扩增试剂,包括链置换型DNA聚合酶、甜菜碱、dNTPs、Mg2+(如MgSO4)、反转录酶和如上所述的引物组。
当所述引物组为所述引物组A时,所述引物1、所述引物2、所述引物3、所述引物4、所述引物5、所述引物6、所述dNTPs、所述Mg2+、所述链置换型DNA聚合酶、所述反转录酶和所述甜菜碱在所述扩增试剂中的配比为40pmol:40pmol:5pmol:5pmol:20pmol:20pmol:35nmol:125nmol:8U:5U:20μmol。
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