[发明专利]一种与鸡繁殖性能相关的分子标记及其在育种中的应用

说明书

技术领域

本发明涉及分子遗传学领域，具体涉及一种与鸡繁殖性能相关的分子标记及其在育种中的应用。

背景技术

骨形态发生蛋白受体(Bone morphogenetic protein receptor IB,BMPR-IB)基因的主要生物学功能包括卵泡生长发育及排卵、骨组织发育、有机体胚胎发育等。研究发现BMPR-IB基因A746G(FecB)位置的单碱基突变导致绵羊多胎性状，并在多个绵羊品种中被确认。王生宝研究表明：小尾寒羊中A746G突变BB基因型个体产羔数极显著高于其他两种基因型个体(P<0.01)，萨寒F1代中杂合型个体产羔数显著高于++型个体(P<0.05)。闫亚东研究表明：高繁殖力绵羊品种与低繁殖力绵羊品种之间，A746G位点基因型分布差异极显著(P<0.001)。方翟等(2010)研究3个绵羊品种中A746G与产羔数的关系，结果表明BB、B+和++基因型个体间产羔数差异显著(P<0.05)。除了羊物种外，在其他动物中关于BMPR-IB遗传效应的研究并不多。宋一萍在猪BMPR-IB基因编码区396bp处检测到C→T突变，BB基因型个体与AA基因型个体在总产仔数和产活仔数性状上差异显著(P<0.05)。而在鸡上，只有Zhang等发现了BMPR-IB基因2个SNP位点C35T和A287G，其中A287G位点与47W至56W的产蛋量显著相关(P<0.05)。已有的研究表明BMPR-IB对动物繁殖性能具有重要的生物学功能，而繁殖性状又是家禽生产的重要经济性状，但目前对与鸡繁殖性状有关的BMPR-IB基因多态位点的挖掘研究却鲜有报道，无法将其应用于鸡的育种。

基因表达是DNA上的遗传信息转录和翻译的过程，目前已在小鼠、牛、羊、猪、鸡等多个物种上证实BMPR-IB基因参与卵巢卵泡发育及排卵，并与原始卵泡募集以及卵泡分化有关。王峰实验结果表明BMPR-IB基因在蒙古牛的卵巢、输卵管、子宫和肾脏4个组织中均有表达。其中，在卵巢和子宫中表达水平较高，而在输卵管和肾脏中的表达水平相对较低。BMPR-IB基因在牛初级卵泡和次级卵泡早期和晚期均有表达。孙瑞珍报道在小鼠和猪的各级卵泡中均有表达，认为BMPR-IB参与成年小鼠和猪卵泡的生长和发育，与猪原始卵泡募集有关。现在对鸡BMPR-IB基因的相关表达研究还相对较少，其机制功能并不明确。

发明内容

本发明通过深入研究实验发现了鸡BMPR-IB基因233062位点处的C→T转换产生的多态位点，该多态位点位于所扩增序列（其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示）的第315bp处。本发明的目的在于克隆BMPR-IB基因233062位点作为分子标记，并将其应用于鸡的育种中。

本发明的技术方案是：一种与鸡繁殖性能相关的分子标记，其特征是，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；在该序列的第315bp处有一个C→T的碱基突变，导致SspⅠ-RFLP的多态性。

扩增上述序列的引物为：

P-233062F：5’-CCCTTCTCAGTTGCTT-3’（SEQ ID No.2）；

P-233062R：5’-CCAAGATTAGTCCCAAA-3’（SEQ ID No.3）；

本发明以鸡的基因组DNA为模板，利用上述引物进行扩增，得到556bp的PCR扩增产物（其序列如SEQ ID No.1所示），该扩增产物包含Ssp I限制性内切酶的识别序列“AAT/ATT”；该扩增产物的第315bp处的“C”不发生突变时，即“AAT/ACT”类型记做“CC”，扩增片段SspⅠ内切酶切不开；当“C”突变为“T”，即“AAT/ATT”类型记做“TT”，可以被SspⅠ内切酶切作314bp和242bp的两条短片段；PCR产物被SspⅠ限制性内切酶消化后用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测，即得到CC（检测到556bp的一条条带）、CT（杂合型，出现556bp、314bp和242bp的三条短片段）、TT（检测到314bp和242bp的两条短片段）三种带型。

本发明通过关联分析表明：该分子标记与开产体重、43W体重、43W蛋重和43W产蛋量均表现出显著或密切相关。基因型CC个体对应最大开产体重、43W体重，且开产体重性状与基因型TT个体间差异显著，43W体重与基因型TT个体间差异极显著。而且该基因型个体43W产蛋量最高。同时，通过对鸡BMPR-IB基因的表达分析表明：BMPR-IB基因与鸡繁殖性能相关。