[发明专利]从残余的经提取种子样品回收基因组DNA

权利要求书

1.一种用于确定植物就至少一个感兴趣的基因座而言的基因型的系统，该系统包括：

已经历溶剂提取的种子样品；

从所述种子样品中结合核酸以产生高品质核酸样品的磁性颗粒；

用于扩增该高品质核酸样品以产生扩增核酸的手段；

选择性地与感兴趣基因座的等位基因杂交的寡核苷酸探针；和

用于根据该寡核苷酸探针与该扩增核酸之间的杂交或缺乏杂交来确定种子样品的基因型的计算机实现的手段。

2.权利要求1的系统，其中所述感兴趣的基因座是基因。

3.权利要求1的系统，其中该系统是完全自动化的。

4.权利要求1的系统，其中该系统包括附接于所述寡核苷酸探针上的荧光指示染料。

5.权利要求1的系统，其中该种子样品已经历通过溶剂提取进行的脂肪酸提取。

6.权利要求1的系统，其中该种子样品来自油料植物。

7.权利要求6的系统，其中该油料植物是芸苔属、大豆或向日葵。

8.利用权利要求1的系统产生的高品质核酸样品。

9.权利要求8的高品质核酸样品，其中该核酸样品的A₂₆₀/A₂₈₀吸光度比值是大约1.7到大约2.0之间，并且其中该核酸样品能够通过聚合酶链式反应(PCR)扩增。

10.一种用于确定植物就至少一个感兴趣的基因座而言的基因型的方法，该方法包括：

提供来自该植物的经历了溶剂提取的种子样品；

从该脱脂的种子样品分离高品质核酸；

扩增该高品质核酸以确定接合性；和

鉴定该扩增核酸的等位基因组成。

11.权利要求10的方法，其中该感兴趣的基因座是基因。

12.根据权利要求10的方法，其中鉴定所述扩增核酸的等位基因组成包括使等位基因特异性探针与所述扩增核酸杂交。

13.根据权利要求10的方法，其中所述溶剂提取包括通过溶剂提取脱脂，其中所提取的油通过酯交换反应被转变成脂肪酸甲酯(FAME)。

14.权利要求11的方法，其中该脂肪酸甲酯用气相色谱定量。

15.根据权利要求10的方法，其中从所述脱脂的种子样品分离高品质核酸是利用基于珠子的DNA提取平台进行的。

16.根据权利要求15的方法，其中该基于珠子的DNA提取平台包括结合核酸的磁性颗粒。

17.根据权利要求10的方法，其中该方法以自动化的方式进行。

18.根据权利要求10的方法，其中扩增所述高品质核酸包括利用聚合酶链式反应(PCR)扩增核酸分子。

19.根据权利要求10的方法，其中该种子样品包括一部分种子子叶，但不包括种子胚。

20.根据权利要求10的方法，其中该方法包括定量分离的核酸样品。

21.根据权利要求10的方法，其中该方法包括为种子样品提供油性状判定。

22.根据权利要求10的方法，其中该植物种子中除所述种子样品之外的部分被选择用于播种。

23.根据权利要求22的方法，其中该植物种子的所述部分由于该植物种子包含感兴趣基因的基因型而被选择。

24.根据权利要求23的方法，其中该植物种子的所述部分进一步由于该植物种子包含感兴趣脂肪酸谱而被选择。

25.根据权利要求22的方法，其中该方法包括播种该被选择的植物种子的所述部分。

26.根据权利要求25的方法，其中播种该种子部分包括将该种子部分置于土壤中。

27.根据权利要求25的方法，其中播种该种子部分包括将该种子部分置于生长支持性培养基中。

28.根据权利要求22的方法，其中该方法包括：在没有让来自不包含感兴趣基因的基因型的植物种子的除所述种子样品之外的植物种子部分萌发的情况下，从不包含感兴趣的基因的基因型的植物种子中弃去除所述种子样品之外的植物种子部分。