[发明专利]用于检测人乳头瘤病毒核酸的组合物和方法在审
申请号: | 201380064307.1 | 申请日: | 2013-10-11 |
公开(公告)号: | CN104884638A | 公开(公告)日: | 2015-09-02 |
发明(设计)人: | A·R·W·施罗德 | 申请(专利权)人: | 简·探针公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70 |
代理公司: | 北京市嘉元知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11484 | 代理人: | 刘彬 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 乳头 病毒 核酸 组合 方法 | ||
1.一种用于检测疑似含有HPV33以及HPV 31、52和58型中的至少一种的样品中的人乳头瘤病毒33型(HPV33)靶标核酸的低聚物组合,所述低聚物组合包括:
用于特异性地扩增HPV33核酸靶标区域的第一扩增低聚物和第二扩增低聚物,其中(a)所述第一HPV33扩增低聚物包含第一靶标杂交序列,所述第一靶标杂交序列为包含在SEQ ID NO:66的序列中的约15至约27个连续核苷酸并至少包括SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:68或SEQ ID NO:69的序列;并且(b)所述第二HPV33扩增低聚物包含第二靶标杂交序列,所述第二靶标杂交序列为包含在SEQ ID NO:70的序列中的约15至约27个连续核苷酸并至少包括SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:72或SEQ ID NO:73的序列。
2.根据权利要求1所述的低聚物组合,还包括用于特异性地扩增HPV31型(HPV31)核酸靶标区域的第一扩增低聚物和第二扩增低聚物,其中(a)所述第一HPV31扩增低聚物包含第一靶标杂交序列,所述第一靶标杂交序列为包含在SEQ ID NO:74的序列中的约15至约27个连续核苷酸并至少包括SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:76或SEQ ID NO:77的序列;并且(b)所述第二HPV31扩增低聚物包含第二靶标杂交序列,所述第二靶标杂交序列为包含在SEQ ID NO:78的序列中的约15至约30个连续核苷酸并至少包括SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:80或SEQ ID NO:81的序列。
3.根据权利要求1或2所述的低聚物组合,其中所述第二HPV33扩增低聚物为还包含位于所述靶标杂交序列5'端的启动子序列的启动子引物或启动子提供者。
4.根据权利要求3所述的低聚物组合,其中所述第二HPV33低聚物的所述启动子序列为T7启动子序列。
5.根据权利要求4所述的低聚物组合,其中所述T7启动子序列具有以SEQ ID NO:82示出的序列。
6.根据权利要求2所述的低聚物组合,其中所述第二HPV31扩增低聚物为还包含位于所述靶标杂交序列5'端的启动子序列的启动子引物或启动子提供者。
7.根据权利要求6所述的低聚物组合,其中所述第二HPV31低聚物的所述启动子序列为T7启动子序列。
8.根据权利要求7所述的低聚物组合,其中所述T7启动子序列具有以SEQ ID NO:82示出的序列。
9.一种用于检测样品中的人乳头瘤病毒33型(HPV33)靶标核酸的低聚物组合,所述低聚物组合包括:
用于扩增HPV33核酸靶标区域的第一扩增低聚物和第二扩增低聚物,其中(a)所述第一HPV33扩增低聚物包含选自SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:8的第一靶标杂交序列;并且(b)所述第二HPV33扩增低聚物包含选自SEQ ID NO:9-SEQ ID NO:16的第二靶标杂交序列。
10.根据权利要求9所述的低聚物组合,还包括用于扩增HPV 31型(HPV31)核酸靶标区域的第一扩增低聚物和第二扩增低聚物,其中(a)所述第一HPV31扩增低聚物包含选自SEQ ID NO:25-SEQ ID NO:33的第一靶标杂交序列;并且(b)所述第二HPV31扩增低聚物包含选自SEQ ID NO:34-SEQ ID NO:41的第二靶标杂交序列。
11.根据权利要求9或10所述的低聚物组合,其中所述第二HPV33扩增低聚物为还包含位于所述靶标杂交序列5'端的启动子序列的启动子引物或启动子提供者。
12.根据权利要求11所述的低聚物组合,其中所述第二HPV33低聚物的所述启动子序列为T7启动子序列。
13.根据权利要求12所述的低聚物组合,其中所述T7启动子序列具有以SEQ ID NO:82示出的序列。
14.根据权利要求13所述的低聚物组合,其中所述第二HPV33扩增低聚物具有选自SEQ ID NO:17-SEQ ID NO:24的序列。
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