[发明专利]乳腺炎抗性的遗传标记

权利要求书

1.一种确定牛受试者中的乳腺炎抗性的方法，包括：从所述牛受试者的样本中检测至少一个遗传标记的存在与否，所述遗传标记与指示所述牛受试者和/或其后代的乳腺炎抗性的至少一个性状相关联，其中所述至少一个遗传标记位于BTA6上的神经肽FF受体2(NPFFR2)基因中，和/或所述至少一个遗传标记位于选自区域1-61的牛基因组的区域中，其中所述区域由列3和5中所鉴定的SNP标记划定，和/或由列4和6中所鉴定的基因组位置划定：

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述遗传标记选自权利要求1中的表格的列9中所列的最显著SNP。

3.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述遗传标记位于选自权利要求1的表格中所列的区域14、34、43和53的区域中。

4.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述遗传标记选自BovineHD0600024355、BovineHD1300017074、BovineHD1600014622和BovineHD2000010279。

5.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述遗传标记位于BTA6上的由SNP标记18708和26792所划定的区域中。

6.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述遗传标记位于BTA6上的神经肽FF受体2(NPFFR2)基因中。

7.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述遗传标记为SNPBovineHD0600024355和/或以遗传方式偶联到SNP BovineHD0600024355的任何遗传标记。

8.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述遗传标记为位于89,059,253Bp(UMD3.1)处的G/A SNP，其中A等位基因与乳腺炎相关联，且G等位基因与乳腺炎抗性相关联。

9.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述遗传标记位于BTA20上的含半胱天冬酶募集结构域的蛋白6(CARD6)基因中，诸如rs133218364T/C SNP，其中T等位基因与乳腺炎相关联，且C等位基因与乳腺炎抗性相关联。

10.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述遗传标记位于BTA20上的白血病抑制因子受体(LIFR)基因的下游5000bp区域中，诸如rs133596506SNP，其中C等位基因与乳腺炎相关联，且T等位基因与乳腺炎抗性相关联。

11.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述遗传标记选自表10、12、13、15、16、18、19、21、23和24中所列的SNP。

12.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述遗传标记位于选自表11、14、17、20、22和25中所列的基因中。

13.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述性状选自CM11(第一次产犊之后的-15天至50天临床乳腺炎(1)或否(0))、CM12(第一次产犊之后的51天至305天临床乳腺炎(1)或否(0)、CM2(第二次产犊之后的-15天至305天临床乳腺炎(1)或否(0))、CM3(第三次产犊之后的-15天至305天临床乳腺炎(1)或否(0))、CM(临床乳腺炎：0.25*CM11+0.25*CM12+0.3*CM2+0.2*CM3)、SCC1(第一哺乳期的体细胞数对数平均值)、SCC2(第二哺乳期的体细胞数对数平均值)、SCC3(第三哺乳期的体细胞数对数平均值)和SCC(体细胞数对数:0.5*SCC1+0.3*SCC2+0.2*SCC3)。

14.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中指示乳腺炎抗性的所述至少一个遗传标记被用于估计实施牛受试者的育种值。

15.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述样本选自血液、精液(精子)、尿液、肌肉、皮肤、毛发、耳朵、尾巴、脂肪和/或唾液。

16.根据前述任一项权利要求所述的方法，其中所述样本是精液(精子)或血液。