[发明专利]锚定前清洗

权利要求书

1.一种对核酸分子的靶序列进行测序的方法，所述方法包括：

(a)提供包含所述核酸分子的表面，所述核酸分子包含：(i)包括第一锚位点的第一衔接物、和(ii)所述靶序列；

(b)将包含有效量的酸、阳离子表面活性剂、或者酸和阳离子表面活性剂两者的水洗溶液涂覆于所述表面上；

(c)将锚定杂交到所述第一锚位点；

(d)延伸所述锚定以产生锚定延伸产物；

(e)检测所述延伸产物，由此鉴定所述靶序列的碱基；和

(f)重复步骤(b)至(e)直到所述靶序列的序列被确定。

2.如权利要求1所述的方法，其中包含所述核酸分子的所述表面是包含表面和连接到所述表面的多个所述核酸分子的核酸阵列。

3.如权利要求1或权利要求2所述的方法，其中所述核酸分子是包含多个单体单元的多联体，各单体单元包括所述第一衔接物和所述靶序列。

4.如前述权利要求中任一项所述的方法，其包括：通过将核苷酸添加到所述锚定或者先前的所述锚定的延伸的产物中，而延伸所述锚定。

5.如前述权利要求中任一项所述的方法，其包括：通过将测序探针连接到所述锚定或者先前的所述锚定的延伸的产物，而延伸所述锚定。

6.如权利要求5所述的方法，其包括：通过(i)将一个或多个延伸锚定连接到所述锚定和(ii)将所述序列探针连接到所述的一个或多个延伸锚定，而延伸所述锚定。

7.如权利要求5所述的方法，其包括：在重复步骤(b)至(e)之前，从所述核酸分子中除去所述延伸产物。

8.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述水洗溶液包含柠檬酸。

9.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述水洗溶液包含溴化十六烷基三甲铵(CTAB)。

10.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述水洗溶液包含一定量的弱酸或阳离子表面活性剂，与合适的对照品相比所述弱酸或阳离子表面活性剂有效地降低不一致性达5％或5％以上或者提高可映射率达0.5％或0.5％以上或有效地降低不一致性达5％或5％以上且提高可映射率达0.5％或0.5％以上。

11.如前述权利要求中任一项所述的方法，其包括：在将所述锚定杂交到所述第一锚位点之前，将水洗溶液涂覆于所述表面。

12.一种用于对连接到表面的核酸分子进行测序的水洗溶液，所述水洗溶液包含酸、阳离子表面活性剂或者两者，其中与合适的对照品相比所述水洗溶液有效地可检测地降低不一致性或者提高可映射率达0.5％或0.5％以上或有效地可检测地降低不一致性且提高可映射率达0.5％或0.5％以上。

13.如权利要求12所述的水洗溶液，其中与合适的对照品相比，所述水洗溶液有效地降低不一致性达5％或5％以上。

14.如权利要求12或权利要求13所述的水洗溶液，其中与合适的对照品相比，所述水洗溶液有效地提高可映射率达0.5％或0.5％以上。

15.如权利要求1至9中任一项所述的方法，其中在步骤(b)中涂覆的水洗溶液是如权利要求12至14所述的清洗溶液。