[发明专利]一种Br-or-Indel分子标记及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及一种Br-or-Indel分子标记及其应用。

背景技术

番茄红素是植物中所含的一种天然色素，为类胡萝卜素的一种，是目前在自然界的植物中被发现的最强抗氧化剂之一。番茄红素清除自由基的功效远胜于其他类胡萝卜素和维生素E。它不仅可以有效的延缓衰老，还具有抗癌抑癌的功效，对增强人体免疫系统等也具有重要意义。

橘红心大白菜是大白菜的一种特色品种，其球内叶为橘红色。有研究表明，大白菜球心橘红色的形成与番茄红素的积累有着密切的关系。李娟（2007）研究表明橙色大白菜结球过程中番茄红素积累特点是先降低然后又回升，普通大白菜中没有检测到番茄红素。熊玉林（2002）、刘秀村（2008）也均研究证明橘红心大白菜结球期心叶含大量的番茄红素，而普通大白菜没有检测到番茄红素。因此，针对大白菜橘红心性状的研究将有利于选育出满足人们对大白菜高营养品质要求的品种。

张德双等（2003）通过大白菜白心及橘红心分离群体的遗传分析表明，橘红色球色对白色为隐性，为质量性状，由一对隐性基因控制。刘秀村等（2003）找到了一个与橘红心球色基因连锁的RAPD分子标记，其遗传距离为3.8cM，但RAPD标记作为显性标记，不能区分杂合型和纯合型，而且易受环境影响重复性差。王琦等（2006）通过对大白菜橙色叶球性状连锁分子标记的筛选，得到了一个与橙色叶球基因的遗传距离为3.7cM的SCOR标记，但此SCOR标记同样是显性标记不能很好的区分杂合型和纯合型。张凤兰等（2008）和冯辉等（2010）通过分离群体筛选得到SCAR标记和共显性标记分别将橘红心球色基因or定位在8cM和13cM及1.3cM和3.3cM之间，但是其遗传距离还相对较远。张俊祥等（2013）利用两个Indel分子标记将or基因定位在0.1cM和0.2cM的范围内，但仍然存在一定的重组率。

大白菜是人们经常食用的重要蔬菜之一，随着人民生活水平的提高，其消费模式也在悄然发生变化。大白菜的品质、色泽等日益受到消费者的青睐。橘红心大白菜品种叶心全部橘红色，菜型美观，营养元素丰富，对人体健康十分有益。大白菜橘红心or基因的研究将会推进品质育种的进程。利用与目标性状共分离的分子标记进行标记辅助选择是在遗传育种中十分有效的方法，分子标记是在DNA水平上对目标性状进行选择，具有高效、快速、不受环境影响等优点，可以在幼苗期进行选择，加快育种过程。

发明内容

本发明的目的是提供一种Br-or-Indel分子标记及其应用。

本发明提供的一对引物，由（1）和（2）所示的两条引物组成：

（1）Br-or-IndelF，该引物的序列如SEQ ID No.3所示；

（2）Br-or-IndelR，该引物的序列如SEQ ID No.4所示。

一种DNA分子也属于本发明的保护范围，该分子的序列如SEQ ID No.5所示。

一种DNA分子也属于本发明的保护范围，该分子的序列如SEQ ID No.6所示。

一种辅助鉴定待测大白菜是纯合白心大白菜、纯合橘红心大白菜还是杂合白心大白菜的试剂盒也属于本发明的保护范围，该试剂盒由上述的两条引物、PCR扩增缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶和ddH₂O组成；

所述试剂盒中包括使用说明书，使用说明书中记载如下内容：以待测大白菜的基因组DNA为模板，以上述的两条引物为引物进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；如果PCR扩增产物为长度为261bp的DNA分子，则待测大白菜为纯合白心大白菜；如果PCR扩增产物为长度为286bp的DNA分子，则待测大白菜为纯合橘红心大白菜；如果PCR扩增产物为长度为261bp的DNA分子和长度为286bp的DNA分子，则待测大白菜为杂合白心大白菜。

上述试剂盒中，所述待测大白菜的基因组DNA为待测大白菜的叶片的基因组DNA；

所述261bp的DNA分子为SEQ ID No.5所示的DNA分子；

所述286bp的DNA分子为SEQ ID No.6所示的DNA分子；

所述纯合白心大白菜具体为白心大白菜91-112；

所述纯合橘红心大白菜具体为橘红心大白菜T12-9；

所述杂合白心大白菜具体为白心大白菜91-112与橘红心大白菜T12-9的杂交F₁代。