[发明专利]一种用于检测猪流感病毒的试剂盒及其应用无效
申请号: | 201310481607.1 | 申请日: | 2013-10-16 |
公开(公告)号: | CN103484572A | 公开(公告)日: | 2014-01-01 |
发明(设计)人: | 鄢明华;张莉;李秀丽;孙英峰;韩伟;路超;任卫科;王利丽;池晶晶;李富强;杨春蕾 | 申请(专利权)人: | 天津市畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 天津市杰盈专利代理有限公司 12207 | 代理人: | 朱红星 |
地址: | 300112 天津市西青区*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 流感病毒 试剂盒 及其 应用 | ||
技术领域
本发明属于动物卫生检验技术领域,特别是一种能够检测H1N1、H3N2、H1N2亚型猪流感病毒的LAMP引物组及制备的试剂盒。
背景技术
猪流感(Swine Influenza ,SI)是由猪流感病毒(Swine Influenza Virus ,SIV)引起的一种急性、高度接触传染性的群发性呼吸道疾病,临床上以突发、高热、咳嗽、呼吸困难为特征。20世纪90年代中期,猪呼吸道疾病综合征(Porcine respiratory disease complex, PRDC)的发生和流行使得猪流感的危害更加突出。此外,由于猪是流感病毒基因重组或重配的“混合器”,是禽与人流感病毒基因重配的重要场所,因此该病还具有重要的公共卫生意义。
目前国内外报道的猪流感实验室诊断方法很多,在病原学诊断方法中主要有病原分离鉴定和RT-PCR等方法。2000年Notomi等首次报道环介导等温扩增( loop-mediated isothermal amplification, LAMP)。该技术是一种新颖的核酸扩增方法,其特点是针对靶基因的6个区域设计特异性引物,在等温条件下(60~65℃)利用Bst链置换DNA聚合酶,高效、快速、特异性扩增靶序列。LAMP方法1h左右即可完成核酸扩增反应,其扩增效率可达到109~1010个数量级,与传统PCR技术相比,该方法具有操作简单,快速灵敏,不需要特殊的仪器设备等优点。
目前,该方法在食品安全检测、流行性病毒检测、临床诊断,以及水产养殖等领域的应用及研究已有相关论文报道。 Enomoto及Kaneko等分别采用LAMP和聚合酶链反应(PCR)两种方法对与伪狂犬病毒同属的7型人类疱疹病毒进行DNA扩增,测得LAMP反应的灵敏性为每管250拷贝,较PCR的敏感性高10倍。wamodo等根据gyrB基因序列针对结核分枝杆菌、鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌的特异引物和16S核糖体RNA保守序列的分枝杆菌属公共引物,用LAMP方法从痰标本中鉴定结核分枝杆菌、鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌,可检测到10个拷贝的细菌。在反应试管中加入SYBR Green I进行检测。如果含有扩增产物,反应混合物变绿;反之,则保持SYBR Green I的橙色不变。本专利依据LAMP技术的原理,针对猪流感病毒NP基因保守序列,通过各种条件的优化和筛选,设计出1组引物,可用于样品中猪流感病毒的检测。
发明内容
本发明的一个目的是提供一种用于检测猪流感病毒的LAMP特异性引物组,其特征在于:
SIV-F3 GTCTCAAGGCACCAAACG SEQ ID NO:1
SIV-B3 AAAAGCAGAGAGCACCAT SEQ ID NO:2
SIV-FIP ACAGATGCTCTGATTTCTGTGGCTTTTTATCGTATGAACAAATGGAGACT
SEQ ID NO:3
SIV-BIP GGTGGAATCGGAAGATTCTACATCTTTTTGCTATTTTGAATTAATCGTCCCT
SEQ ID NO:4
(1)它是针对猪流感病毒NP基因的保守区域设计的。
(2)可检测出H1N1、H3N2、H1N2亚型的猪流感病毒。
本发明的另一个目的是提供含有上述引物组的试剂盒。所述的试剂盒包括:
(1)LAMP反应液:
每22μL LAMP反应液中含有:2×Buffer(含Mg2+) 2.5μL;SIV-F3 0.5μL; SIV-B3 0.5μL;SIV-FIP 4μL;SIV-BIP 4μL;dNTPs 3.5μL;水7μL
(2)8U/μL Bst酶
(3)用于检测猪流感病毒的LAMP特异性引物组,其中的引物指的是:
SIV-F3 GTCTCAAGGCACCAAACG SEQ ID NO:1
SIV-B3 AAAAGCAGAGAGCACCAT SEQ ID NO:2
SIV-FIP ACAGATGCTCTGATTTCTGTGGCTTTTTATCGTATGAACAAATGGAGACT
SEQ ID NO:3
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