[发明专利]用于鉴定茄病镰刀菌或/和尖孢镰刀菌的引物序列、试剂盒及其方法有效
申请号: | 201310308711.0 | 申请日: | 2013-07-18 |
公开(公告)号: | CN104263813A | 公开(公告)日: | 2015-01-07 |
发明(设计)人: | 严蕾艳;王毓洪;应泉盛;王迎儿;宋慧;张华峰;古斌权 | 申请(专利权)人: | 宁波市农业科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/77 |
代理公司: | 宁波诚源专利事务所有限公司 33102 | 代理人: | 袁忠卫 |
地址: | 315040 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 镰刀 引物 序列 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种用于鉴定茄病镰刀菌的引物序列,其特征在于:上游引物具有序列表中SEQ ID NO:1所述的碱基序列,下游引物具有序列表中SEQ ID NO:2所述的碱基序列。
2.一种检测茄病镰刀菌的试剂盒,其特征在于:该试剂盒包含权利要求1所述的引物。
3.一种鉴定茄病镰刀菌的方法,其特征在于:提取待测样品DNA作为模版,利用权利要求1所述的引物进行PCR扩增反应,PCR产物经凝胶电泳后用溴化乙锭染色,根据凝胶中条带大小判断:若存在347-bp的DNA条带,则检测样品中含有茄病镰刀菌。
4.一种用于鉴定尖孢镰刀菌的引物序列,其特征在于:上游引物具有序列表中SEQ ID NO:3所述的碱基序列,下游引物具有序列表中SEQ ID NO:2所述的碱基序列。
5.一种检测尖孢镰刀菌的试剂盒,其特征在于:该试剂盒包含权利要求4所述的引物。
6.一种鉴定尖孢镰刀菌的方法,其特征在于:提取待测样品DNA作为模版,利用权利要求4所述的引物进行PCR扩增反应,PCR产物经凝胶电泳后用溴化乙锭染色,根据凝胶中条带大小判断:若存在228-bp的DNA条带,则检测样品中含有尖孢镰刀菌。
7.一种用于同时鉴定茄病镰刀菌和尖孢镰刀菌的引物序列,其特征在于:包括三条引物,第一条引物具有序列表中SEQ ID NO:1所述的碱基序列,第二条引物具有序列表中SEQ ID NO:2所述的碱基序列,第三条引物具有序列表中SEQ ID NO:3所述的碱基序列。
8.一种同时检测茄病镰刀菌和尖孢镰刀菌的试剂盒,其特征在于:该试剂盒包含权利要求7所述的引物。
9.一种鉴定茄病镰刀菌和尖孢镰刀菌的方法,其特征在于:提取待测样品DNA作为模版,利用权利要求7所述的引物进行PCR扩增反应,PCR产物经凝胶电泳后用溴化乙锭染色,根据凝胶中条带大小判断:若存在347-bp的DNA条带,则检测样品中含有茄病镰刀菌;若存在228-bp的DNA条带,则检测样品中含有尖孢镰刀菌。
10.根据权利要求3或6或9所述的方法,其特征在于:所述的PCR反应的扩增体系为:1μL DNA模板(约0.4ng),引物各0.2μmol l-1,dNTP0.2μmol l-1,MgCl22mmoll-1,1×缓冲液,聚合酶1.5U个单位,双蒸水补足至25μL。
11.根据权利要求10所述的方法,其特征在于:所述的PCR反应条件为:95℃预变性3min,94℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸30s,进行35个循环,最后72℃延伸5min。PCR产物用1.5%的琼脂糖在1×TAE缓冲液中电泳后,用溴化乙锭显色拍照。
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