[发明专利]硫代修饰寡聚核苷酸荧光探针及其在核酸酶检测中的应用有效
申请号: | 201310239614.0 | 申请日: | 2013-06-17 |
公开(公告)号: | CN103333888A | 公开(公告)日: | 2013-10-02 |
发明(设计)人: | 赵美萍;苏昕;张晨;柳杨;肖先金 | 申请(专利权)人: | 北京大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68;C12Q1/34 |
代理公司: | 北京君尚知识产权代理事务所(普通合伙) 11200 | 代理人: | 董琍雯 |
地址: | 100871 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 修饰 核苷酸 荧光 探针 及其 核酸酶 检测 中的 应用 | ||
1.一种硫代修饰寡聚核苷酸荧光探针,具有茎环结构,其环部为单链结构,由4-8个核苷酸残基组成,茎部由8-15对核苷酸残基组成,该探针从5’端部开始有六个碱基之间为硫酰化磷酸二酯键,从3’端开始有七个碱基之间为硫酰化磷酸二酯键,荧光基团FAM标记在5’→3’第五个碱基上,猝灭基团BHQ1标记在3’→5’第六个碱基上。
2.一种硫代修饰寡聚核苷酸荧光探针,具有茎环结构,其环部为单链结构,由4-8个核苷酸残基组成,茎部由8-15对核苷酸残基组成,该探针每两个碱基之间的磷酸二酯键全部硫酰化,只有3’末端的碱基与其上标记的荧光基团之间连接的磷酸基团不硫酰化,猝灭基团标记在3’→5’第四个碱基上。
3.一种硫代修饰寡聚核苷酸荧光探针,具有茎环结构,其环部为单链结构,由4-8个核苷酸残基组成,茎部由8-15对核苷酸残基组成,该探针除AP位点5’以外的磷酸二酯键全部硫酰化,AP位点在5’→3’第八个碱基、荧光基团在5’→3’第三个碱基、猝灭基团在3’→5’第二个碱基。
4.如权利要求1-3任一所述的硫代修饰寡聚核苷酸荧光探针,其特征在于,所述荧光基团选自FAM、TAMRA、Cy3或Cy5,所述猝灭基团选自BHQ1或BHQ2。
5.权利要求1所述的硫代修饰寡聚核苷酸荧光探针在非限制性核酸内切酶检测中的应用。
6.如权利要求5所述的应用,其特征在于,所检测的非限制性核酸内切酶包括DNase I。
7.权利要求2所述的硫代修饰寡聚核苷酸荧光探针在核酸外切酶检测中的应用。
8.如权利要求7所述的应用,其特征在于,所检测的核酸外切酶是具有3’-5’外切活性的核酸酶,包括核酸外切酶III。
9.权利要求3所述的硫代修饰寡聚核苷酸荧光探针在脱嘌呤/脱嘧啶位点内切酶检测中的应用。
10.如权利要求9所述的应用,其特征在于,所检测的脱嘌呤/脱嘧啶位点内切酶包括核酸内切酶IV和人脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶。
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