[发明专利]用于筛选有瘤/无瘤黄瓜果实类型的显性分子标记

说明书

技术领域

本发明涉及基因工程技术领域的分子标记，特别涉及用于筛选有瘤/无瘤黄瓜果实类型的显性分子标记。

背景技术

黄瓜(Cucumis sativus L.；2n＝2x＝14)属于葫芦科(Cucurbitaceae)黄瓜属(Cucumis)一年蔓生的草本植物，是世界上极其重要蔬菜作物之一，黄瓜果实属于瓠果，由子房和花托共同发育而成。果实是黄瓜经济性状最重要的部分，可以生吃，烹饪或加工。

黄瓜果瘤性状属于区别于其他葫芦科果实的特异性状，果实是黄瓜经济性状最重要的部分，通常情况下，黄瓜果实分为有瘤类型和无瘤类型，与有瘤类型相比无瘤类型黄瓜外观光滑黄瓜残留农药低，清洗方便，口感好，食用卫生，容易运输、包装和储存等优点，但世界上不同地区，不同人们对有瘤黄瓜和无瘤黄瓜有着不同的喜好。因此，果瘤性状已经成为影响黄瓜(包含刺色、果皮颜色、果耙长短和有无光泽等等)市场价值的重要因素。随着人们生活水平的提高，黄瓜果实品质性状已提到重要位置，特别是外部品质性状是引起消费者购买的直接因素。因此研究果瘤性状会提高黄瓜品质育种进程，产生一定的经济价值，这些因素使得研究黄瓜果瘤性状尤为重要，但目前对于黄瓜果瘤性状的研究报道很少。

果瘤基因的研究始于1913年，有果瘤是黄瓜的野生性状，果瘤性状是由Tu(Tuberculate fruit)基因调控，有果瘤(Tu)为显性，无果瘤(tu)为隐性。曹辰兴通过分离群体的遗传分析结果表明控制茎、叶、果实表皮毛性状的无毛基因对控制果瘤性状的果瘤基因存在隐性上位作用(曹辰兴等.黄瓜茎叶无毛性状与果实瘤刺性状的遗传关系.园艺学报，2001，28(6)：565-566)。因此，果瘤基因Tu的研究将有助于揭示黄瓜果刺基因形成的分子机制，为黄瓜遗传和育种工作奠定基础。但目前对于黄瓜果瘤性状的研究报道很少。

2010年张微微等研究黄瓜果瘤性状时通过细胞学连续观察，发现果瘤的形态建成实际上是源于果刺下靠近刺座细胞的几层瘤细胞大量分裂导致细胞数量显著增加而形成的，并且指出果瘤性状的属于单基因控制的显性性状，同时利用F₂群体的247个体将果瘤基因Tu初步定位于第五染色体的SSR标记16203和SCAR标记C_SC933之间，遗传距离分别为1.4cM和5.9cM，详细结果可以参看：ZhangWW等在《Theoretical and Applied Genetics》(理论应用遗传学)2009年第120卷第3期645-654页发表的题为《Identification and mapping of molecular markerslinked to the tuberculate fruit gene in the cucumber(Cucumis sativus L.)》(黄瓜果瘤基因紧密连锁分子标记初步定位)一文，上述标记还存在分析群体相对较小，连锁距离相对较远等问题，候选区间存在100多个候选基因，也没有对候选基因分析。

随着人们生活水平的提高，品质育种已提到重要位置。用与目的性状紧密连锁的分子标记进行标记辅助选择在黄瓜遗传育种中是十分有效的方法，分子标记是在DNA水平上对目标性状进行选择，具有高效、快速、不受环境条件限制等优点，可在苗期进行选择，加快育种的进程。

发明内容

本发明的目的，在于克服现有技术的不足，提供一个用于筛选有瘤/无瘤黄瓜果实类型的显性分子标记以及用于控制果瘤性状的果瘤基因。

本发明是通过以下技术方案实现的：

本发明用于筛选有瘤/无瘤黄瓜果实类型的显性分子标记，命名为Y68，由序列表中SEQ ID NO.1所示的486个核苷酸组成，无果瘤品种不含有这486个核苷酸。世界各地有瘤黄瓜品种均含有该显性分子标记，无瘤黄瓜品种(除了突变体无毛无瘤品种gl)不含有该显性分子标记，该显性分子标记可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜有瘤/无瘤类型(除了突变体无毛无瘤品种gl)的筛选。

上述用于筛选有瘤/无瘤黄瓜果实类型的显性分子标记Y68，由SEQ ID NO.2所示的上游引物和SEQ ID NO.3所示的下游引物扩增得到。引物由上海生工合成。

本发明涉及的用于控制控制黄瓜果瘤性状的果瘤基因，其蛋白编码序列由序列表中SEQ ID NO.4所示的213个氨基酸组成，是含有单锌指结构的C₂H₂型锌指蛋白的一个转录因子，研究该转录因子可以为黄瓜无毛基因(gl)的鉴定及进一步阐明黄瓜毛和瘤的形态建成机理打下坚实的基础。