[发明专利]用于筛选有瘤/无瘤黄瓜果实类型的显性分子标记有效

专利信息
申请号: 201310013138.0 申请日: 2013-01-14
公开(公告)号: CN103074338A 公开(公告)日: 2013-05-01
发明(设计)人: 杨绪勤;蔡润;何欢乐;朱文莹;潘俊松 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12N15/29;C12Q1/68
代理公司: 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 代理人: 杨元焱
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 用于 筛选 黄瓜 果实 类型 显性 分子 标记
【权利要求书】:

1.用于筛选有瘤/无瘤黄瓜果实类型的显性分子标记,命名为Y68,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,有瘤黄瓜品种含有该标记,无瘤黄瓜品种不含有该标记。

2.根据权利要求1所述的用于筛选有瘤/无瘤黄瓜果实类型的显性分子标记,其特征在于:由SEQ ID NO.2所示的上游引物和SEQ ID NO.3所示的下游引物扩增得到,其扩增程序为:94℃5min;35cycles,94℃25s;54℃25s;72℃30s;72℃5min。

3.用于控制黄瓜果瘤性状的果瘤基因,其蛋白编码序列由SEQ ID NO.4所示的213个氨基酸组成,无瘤品种不含有该213个氨基酸。

4.根据权利要求3所述的用于控制黄瓜果瘤性状的果瘤基因,其特征在于:所述果瘤基因为锌指蛋白基因,该锌指蛋白基因的蛋白编码序列含有6个C2H2锌指蛋白的特异氨基酸序列结构-QALGGH,是一个转录因子,该蛋白能促进黄瓜果实表皮紧靠表皮毛基部部位的细胞的分裂。

5.根据权利要求3所述的用于控制黄瓜果瘤性状的果瘤基因,其特征在于:所述蛋白编码序列存在于黄瓜品种9930基因组序列Scaffold000083和黄瓜品种Gy14黄瓜基因组序列Scaffold02633中。

6.根据权利要求3所述的用于控制黄瓜果瘤性状的果瘤基因的鉴定,其特征在于:利用有瘤亲本和无瘤亲本杂交获得F1,F1再自交获得F2群体,再利用F2群体的2808株个体,根据果瘤基因初步定位结果,结合公布的黄瓜基因组序列开发多态性标记,使用染色体步移技术将果瘤基因定位于SSR42和SNP18之间的候选区域含有41.6kb的核苷酸序列内,该含有41.6kb的核苷酸序列包含磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因和C2H2锌指蛋白基因,其中C2H2锌指蛋白基因CDNA区域序列在两亲本之间存在巨大差异,而磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因不存在差异,最后得出C2H2锌指蛋白基因就是控制黄瓜果瘤性状的果瘤基因。

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