[发明专利]用于预测癌症复发的方法和装置

说明书

技术领域

本发明涉及用于预测癌症患者的癌症复发的方法、装置和试剂盒。

背景技术

对得自患者的肿瘤样品进行基因表达分析已经被用于促进癌症预后和诊断。基因表达谱可以揭示患者中癌症的存在，其类型、分期阶段和起源，以及是否涉及基因突变。基因表达甚至可能在预测化学疗法的效力中起作用。

近年来，已经发现了一类新的调节分子，即微RNA。确定它们在癌细胞中的浓度或表达已经揭示了其在癌症中的作用。已经证实，微RNA的检测可以用于确定癌症的起源部位，且可以用于区分侵袭性癌症和非侵袭性癌症。在基因和微RNA的表达水平中所含的信息是互补的，在预测或诊断方法中组合该信息可以产生在临床上更准确的和有用的结果。

肺癌是具有高死亡率的疾病。即使在外科手术以后，大多数肺癌患者经历复发和死亡。如果切除的肿瘤的直径超过3 cm，护理标准是给患者提供化学疗法以预防复发。如果肿瘤的直径小于3 cm且没有观察到肿瘤的扩散(也被称作Ia期)，则不给患者提供进一步治疗。仍然有超过半数的肺癌患者经历复发，并在5年内死亡。

需要在一种或多种针对癌症的医学治疗（包括外科手术）以后预测癌症患者的癌症复发的方法。

发明内容

本发明包括用于在一种或多种癌症治疗(例如，外科手术、放射疗法和/或化学疗法)之前或之后预测癌症患者的癌症复发的方法，所述方法通过确定至少一种生物标志物(例如，超过一种生物标志物，诸如2、3或4种或更多种生物标志物)的表达水平进行，其中所述生物标志物与hsa-miR-513b、hsa-miR-650、hsa-miR-324-3p和hsa-miR-1307(分别是SEQ ID NO: 1-4)中的任一个的序列具有至少85% (例如，85%、90%、95%、97%、99%或100%) 序列同一性。在一个实施方案中，所述方法涉及或者单一地或者以2种、3种或所有4种生物标志物的任意组合(同时地或依次地)确定生物标志物的表达水平，所述生物标志物具有hsa-miR-650、hsa-miR-324-3p、hsa-miR-513b和hsa-miR-1307中的任一个的序列。

在另一个实施方案中，本发明的方法可以包括：确定hsa-miR-650、hsa-miR-324-3p、hsa-miR-513b和hsa-miR-1307生物标志物(或与hsa-miR-650、hsa-miR-324-3p、hsa-miR-513b和hsa-miR-1307生物标志物中的任一个的序列具有至少85%、90%、95%、97%、99%或100%序列同一性的生物标志物)的配对组合的表达水平。在另一个实施方案中，本发明的方法可以包括：确定hsa-miR-650、hsa-miR-324-3p、hsa-miR-513b和hsa-miR-1307生物标志物(或与hsa-miR-650、hsa-miR-324-3p、hsa-miR-513b和hsa-miR-1307生物标志物中的任一个的序列具有至少85%、90%、95%、97%、99%或100%序列同一性的生物标志物)的三联或四联组合的表达水平。本发明的方法可以包括：同时或依次确定2种或更多种生物标志物(例如，2、3或4种生物标志物)的表达水平。

本发明的方法包括：确定得自癌症患者的样品中的生物标志物的表达水平。所述样品可以是血液样品或组织样品，例如，肿瘤样品。本发明的方法可以用于在癌症患者的第一癌症治疗之前或之后预测任意类型的癌症（例如，肺癌，诸如非小细胞肺癌）的复发。在本发明的一个实施方案中，预测癌症患者的癌症复发的方法可以发生在第一癌症治疗之后。可替换地，所述预测可以发生在第一癌症治疗之前。在另一个实施方案中，所述预测可以发生在在第一治疗之后但是在第二治疗之前。可替换地，所述预测可以发生在第二癌症治疗之后。在本发明中描述的癌症治疗可以包括以下的一种或多种：外科手术、放射疗法和化学疗法和/或本领域已知的用于治疗癌症的任意其它疗法。在本发明的一个方面，化学治疗剂可以包括以下的一种或多种：药物、抗体和寡核苷酸。