[发明专利]一种HIV-1耐药野生型基因合成方法无效
申请号: | 201210514875.4 | 申请日: | 2012-12-04 |
公开(公告)号: | CN102978199A | 公开(公告)日: | 2013-03-20 |
发明(设计)人: | 李凯;张佳;季晓英 | 申请(专利权)人: | 苏州大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人: | 范晴 |
地址: | 215123 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 hiv 耐药 野生型 基因 合成 方法 | ||
1.一种HIV-1耐药野生型基因合成方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1) 把HIV-1耐药野生型基因,分成若干N段(n=20-40)的A碱基片段,即 A1,A2,A3,A4,A5…An,并进行人工合成,
设计并人工合成与上述片段互补的N-1碱基片段,即B1,B2,B3,B4…Bn-1 ;其中,任一Bn碱基片段的5’端比各耐药野生型基因片段的An碱基片段5’端后移20-25bp;Bn碱基片段的端延伸到耐药野生型基因片段的An+1碱基片段5’端20-25bp,
根据上述相互匹配的两两对应互补片段设计并合成正向、反向引物;
(2)将上述相互对应部分互补的碱基片段分别进行PCR扩增,即A1/B1, A2/B2, A3/B3…… An/Bn,由部分互补变为完全互补片段;
(3)再将上述具有互补片段的相邻扩增产物,二次扩增;
(4)以3个A碱基片段为单位分别合成167bp片段,并需要进行琼脂糖凝胶的割胶回收纯化,标记为C1,C2,C4,C5…Cn/3, 最后一个An片段可与Cn/3连接;
(5)再运用PCR分别两两扩增C1和C2;C3和C4,C5和C6,C7和C8,C9和C10各可得到309bp片段,标记为D1,D2,D3,D4,D5;
(6)再运用PCR分别两两扩增D1和D2,D3和D4可得598bp片段,标记为E1,E2,D5跟E2连接可得F1=887bp;
(7)最后将E1和F1进行PCR连接就可以得到1508bp的片段;
(8)将片段插入TA载体中,并鉴定野生型模板是否构建正确。
2.根据权利要求1所述的HIV-1耐药野生型基因合成方法,其特征在于,
所述步骤(1)中,把HIV-1耐药野生型基因分成31段并进行人工合成,每段含有44-49个碱基,如Seq No.1~31所示;
设计并人工合成与HIV-1耐药野生型基因互补的碱基片段30段,每段含40个碱基,如Seq No. 32~61所示;
根据上述相互匹配的两两对应互补片段设计并合成正向、反向引物,如Seq No. 62~101所示。
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