[发明专利]与肝癌易感性相关的单核苷酸多态性位点rs7574865及其应用

说明书

技术领域

本发明属于生物技术的基因领域，具体涉及一个与肝癌易感性相关的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）位点及其应用。

背景技术

肝癌是世界上第七大常见恶性肿瘤，在癌症相关死因中位于第三位（Yang JD,Roberts LR.Hepatocel lular carcinoma:A global view.Nat Rev Gastroenterol Hepatol.2010;7:448-58.），全球每年预计新发病例74.83万人，病死例数约69.59万人,其中半数以上的肝癌病例都集中在中国（Jemal A,Bray F,Center MM,Ferlay J,Ward E,Forman D.Global cancer statistics.CA Cancer J Clin.2011;61:69-90.）。

在世界范围内，慢性乙肝和慢性丙肝是肝癌的主要风险因子，几乎80%的肝癌病人均有乙肝或丙肝病史，54%的肝癌病人其患癌的原因是乙肝病毒的感染；但是在中国，超过80%的肝癌病人均有乙肝病史（Tanaka M,Katayama F,Kato H,Tanaka H,Wang J,Qiao YL,Inoue M.Hepatitis B and C virus infection and hepatocellular carcinoma in China:a review of epidemiology and control measures.J Epidemiol.2011;21:401-16.）。

中国是世界上的乙肝大国，普通人群中乙肝表面抗原（HBsAg）的阳性率为高达9%，有1.2亿人曾经感染过乙肝病毒，其中有3000万人转化成为了慢性乙肝，占全世界所有乙肝病人的三分之一。患慢性乙肝五年后，有10-20%的人将发展成为肝硬化；有约6-15%的慢性乙肝和肝硬化病人会发展成为肝癌（Liu J,Fan D.Hepatitis B in China.Lancet.2007;369(9573):1582-3.）。

乙肝发展成为肝癌的风险因素有很多，其中遗传因素是乙肝发展成为肝癌的重要风险因素。研究表明，相比于没有肝癌家族史的乙肝病人而言，有肝癌家族史的乙肝病人发展成为肝癌的相对风险（relative risk，RR）是2.41，有两个以上亲属是肝癌患者的乙肝病人发展成为肝癌的RR高达5.55（Yu MW,Chang HC,Liaw YF,Lin SM,Lee SD,Liu CJ,Chen PJ,Hsiao TJ,Lee PH,Chen CJ.Familial risk of hepatocellular carcinoma among chronic hepatitis B carriers and their relatives.J Natl Cancer Inst.2000;92:1159-64.）。

造成个体之间差异的遗传物质基础之一就是SNP。SNP是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，它是人类可遗传的基因组变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在，平均每500～1000个碱基对中就有1个，估计其总数可达300万个甚至更多(Collins FS,Brooks LD,Chakravarti A.A DNApolymorphism discovery resource for research on human genetic variation.Genome Res.1998;8(12):1229-31.)。目前，SNP是研究人类常见疾病遗传变异的重要依据。但是，至今未见有本发明涉及的STAT4基因与肝癌相关联的报道，也没有关于STAT4基因上多态性位点与肝癌的相关性以及针对具体SNP的检测方法和检测试剂盒的报道。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与肝癌易感性相关的STAT4基因序列，通过SNP位点rs7574865的序列研究，提出一种利于肝癌高危人群的筛查的方法，为肝癌的易感性鉴定，以及预防和治疗提供了一个新的途径。

本发明的研究表明，STAT4基因与肝癌的易感性相关。

本发明首先提供与肝癌易感性相关的STAT4基因上的部分基因序列，该基因序列的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示，其第501位为T或者G。