[发明专利]一种用于检测对虾五种病毒的引物、液相芯片及其用途无效
申请号: | 201210439982.5 | 申请日: | 2012-11-06 |
公开(公告)号: | CN102912041A | 公开(公告)日: | 2013-02-06 |
发明(设计)人: | 谢明星;彭小莉;刘棠;王群力;陈伟玲;王伟;陈双雅;刘荭;郑晓聪;王景明 | 申请(专利权)人: | 厦门出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 厦门市诚得知识产权代理事务所(普通合伙) 35209 | 代理人: | 赖开慧 |
地址: | 361000 福建*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 对虾 病毒 引物 芯片 及其 用途 | ||
技术领域
本发明涉及生物技术领域,特别是涉及检测芯片领域,尤其涉及一种用于检测对虾病毒的引物、液相芯片及其用途。
背景技术
随着水产养殖规模的扩大,特别是在集约化养殖的情况下,养殖水体、环境的恶化,养殖密度的增大,水体富营养化和饲养管理不当等,再加上对虾属无脊椎动物,缺乏特异性免疫系统等,导致近年来养殖病害的扩大和蔓延,甚至发展到愈演愈烈的趋势。对虾病毒尚不能进行体外培养,对虾病毒病不仅无特效药可治,而且造成大规模毁灭性的死亡。更令人担忧的是各种病害防治还只是停留在化学治疗水平,为防止继发和混合感染,药物滥用已造成病原菌广泛耐药,同时水产品的药物残留已成社会关注的问题,甚至导致对虾出口受阻,影响国际名声,危害消费者的健康,严重妨碍对虾养殖业的健康发展。为此,建立快速、灵敏、特异的对虾病毒诊断技术不仅能快速确诊病因,及时检测病害发生及发展趋势,而且也是今后加强科学养殖管理,建立进出口对虾种苗及其产品的检验检疫体系,实现现代化养殖所必需的。
对虾病害检测技术的研究在国内起步相对较晚,但近年来随着分子生物学技术的应用,有力推动了对虾病原检测的发展。国内在对虾病毒的检测方面分别建立了几种主要病原的免疫学技术、核酸探针及PCR检测技术的研究。但由于国内养殖状况主要是个体、分散和粗放等形式,对致病病原体的种苗检测、早期监控、定期检测等病害检测体系基本上没有建立,往往是发病后才引起关注,这与国外大型养殖公司相比,还存在着相当大的差距。
基因芯片是分子生物学和微细加工技术相结合的产物,目前基因芯片技术广泛应用于基因图绘制、表达谱分析、多态性研究、序列测定,同时也在疾病研究和病毒感染诊断等方面得到了广泛的应用。鉴于我国对虾病毒病发生流行时往往是几种病毒病混合、交叉或继发感染,仅凭疾病的流行特征、发病症状及组织学病理等方法是很难对其进行准确的诊断,更何况有些表面健康的虾,由于受到水质环境、饵料和病毒本身特性的影响都或多或少的携带有一种或几种病毒。目前人们最常采用的PCR技术以其高灵敏度虽然为病毒感染的诊断提供了一种有力的工具,但同时非特异性产物的增多也容易导致临床诊断错误,故必须将PCR产物进行测序,否则检查结果不可信。特别是需要大批量的同时检测几种病毒病时,采用单一PCR方法逐一检测时,则比较费时、费力和费钱,难于推广。
白斑综合症病毒(WSSV)、桃拉综合征病毒(TSV)、黄头病病毒(YHV)、传染性皮下及造血组织坏死病病毒(IHHNV)和传染性肌肉坏死病病毒(IMNV)是感染对虾最重要的病毒之一。因此,目前急需一种成本低,方法简单,准确率高的检测五种病毒的方法。
发明内容
本发明的目的是提供一种简便快捷、准确率高、特异性好、灵敏度高,高通量的检测对虾病毒的方法。
为实现上述目的,本发明提供检测对虾一至五种病毒液相芯片检测引物。
其上游引物具有R1-R2-R3所表示的序列,,其中R1与液相芯片的微球连接序列反向互补,R3与待检测序列互补,R2为多聚dT,或寡聚四聚乙二醇,或(CH2)n间臂,n≥3;优选R2为(CH2)n间臂,n为12或18;更优选R2为(CH2)n间臂,n为18;下游引物标记生物素。
其引物序列为以下至少一对:检测WSSV的引物:上游引物中R1为SEQ ID NO:1,R3为SEQ ID NO:2,下游引物为SEQ ID NO:3,并5’端标记生物素;检测TSV的引物:上游引物中R1为SEQ ID NO:4,R3为SEQ ID NO:5,下游引物为SEQ ID NO:6,并5’端标记生物素;检测YHV的引物:上游引物中R1为SEQ ID NO:7,R3为SEQ ID NO:8,下游引物为SEQ ID NO:9,并5’端标记生物素;检测IHHNV的引物:上游引物中R1为SEQ ID NO:10,R3为SEQ ID NO:11,下游引物为SEQ ID NO:12,并5’端标记生物素;检测IMNV的引物:上游引物中R1为SEQ IDNO:13,R3为SEQ ID NO:14,下游引物为SEQ ID NO:15,并5’端标记生物素。
本发明还涉及一种用于检测对虾一至五种病毒的液相芯片,其特征是,包括:
1)所述引物;
2)偶联一定核苷酸序列的微球,所述序列选自SEQ ID NO:16-20,并能相应的与1)中引物序列互补配对。
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