[发明专利]一种溶珊瑚弧菌多重毒力因子GeXP快速检测试剂盒和检测方法有效
申请号: | 201210364679.3 | 申请日: | 2012-09-26 |
公开(公告)号: | CN102899412A | 公开(公告)日: | 2013-01-30 |
发明(设计)人: | 陈偿;刘助红;高磊;任春华;胡超群 | 申请(专利权)人: | 中国科学院南海海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12R1/63 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星 |
地址: | 510301 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 珊瑚 弧菌 多重 毒力 因子 gexp 快速 检测 试剂盒 方法 | ||
技术领域:
本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种专用于可导致珊瑚发生白化现象的病原弧菌—溶珊瑚弧菌(Vibrio coralliilyticus)的快速检测试剂盒和检测方法。
背景技术:
溶珊瑚弧菌(Vibrio coralliilyticus)是一种嗜盐性革兰阴性菌,属于弧菌科弧菌属,不能产生孢子的杆状细菌,因具有单根鞭毛而具有运动性,在海洋琼脂上菌落呈现奶油色,在TCBS培养基上显黄色,菌落边缘整齐光滑,最适生长温度为30摄氏度,最早从印度洋的白化珊瑚Pocillopora damicornis被分离到,后来在太平洋和红海地区的白化珊瑚中也陆续被分离到,同时在北大西洋牡蛎的幼体中也有发现。
近30年来,频繁爆发的各种珊瑚疾病是造成珊瑚退化的重要原因之一,其中白化病害因为具有强烈的传染性而对珊瑚的危害最为严重。在最初,研究者都认为珊瑚白化是由于外部环境变化引起,随着研究的不断深入,最后发现白化作为一种病害,是病原弧菌感染导致。其中溶珊瑚弧菌(Vibrio coralliilyticus)便是典型可以导致珊瑚发生白化现象的病原细菌。当水温高于26摄氏度时,该弧菌可以表达毒力因子感染珊瑚宿主、抑制与珊瑚共生的虫黄藻的光合作用,而使珊瑚发生白化现象。
目前检测病原微生物的方法很多,既有传统的分离鉴定的方法,也有免疫学的方法,但采用最多的还是分子生物学的方法,其主要依赖于PCR技术对某些特异性的基因进行扩增。可是这些方法都存在一定的缺陷:(1)检测耗时,过程繁琐;(2)检测灵敏度低,检测出病原菌时往往是发病晚期;(3)检测的目标基因过于单一,容易漏检,由于环境差异导致的同种不同菌株,不能全面反应该种病原菌的潜在致病性。因此,在做病原细菌的检测时,只有同时检测尽可能多的特异基因,才能使检测结果更加具有可靠性,对病原细菌的鉴定更加准确。
发明内容:
本发明的第一个目的是提供一种更为快速准确地评价溶珊瑚弧菌(Vibrio coralliilyticus)致病性的溶珊瑚弧菌多重毒力因子GeXP快速检测试剂盒。
本发明的溶珊瑚弧菌(Vibrio coralliilyticus)多重毒力因子GeXP快速检测试剂盒,包括PCR反应试剂,多基因PCR引物和GeXP多重扩增反应试剂,其特征在于,所述的多基因PCR引物包括20对溶珊瑚弧菌多重毒力相关因子的PCR引物和一对通用引物,具体为:
含有荧光标记的通用引物对序列,可按常规技术将荧光标记加到下述通用引物序列上,所述的荧光标记优选为CY5荧光标记,位于通用引物对序列的5’端:
TY-F:5’-AGGTGACACTATAGAATA-3’
TY-B:5’-GTACGACTCACTATAGGGA-3’
为毒力相关基因flhA(GenBank:NZ_ACZN01000015)设计的引物,扩增的片段大小约为147bp:
flhA-F:AGGTGACACTATAGAATATCCATATCAGGGCGAATCTC
flhA-R:GTACGACTCACTATAGGGACTTATTCCTGCGGTCCACAT
为毒力相关基因TonB(GenBank:NZ_ACZN01000007)设计的引物,扩增的片段大小约为154bp:
TonB-F:AGGTGACACTATAGAATACTCCTCAATCACAGCGTTCA
TonB-R:GTACGACTCACTATAGGGAGGCTTGAGTGTCAGCAACAA
为毒力相关基因RpoE(GenBank:NZ_ACZN01000012)基因设计的引物,扩增的片段大小约为161bp:
RpoE-F:AGGTGACACTATAGAATATTGCAAAAGGGGTTGAATCT
RpoE-R:GTACGACTCACTATAGGGACGAGCTTGATGGCTTGAGTT
为毒力相关基因dnaJ(GenBank:HM215580.1)基因设计的引物,扩增的片段大小约为168bp:
dnaJ-F:AGGTGACACTATAGAATATCGGTGACATTTTTGGTGAC
dnaJ-R:GTACGACTCACTATAGGGAGCGAACCGCTTCTTCTAGTG
为毒力相关基因VgrG(GenBank:NZ_ACZN01000017)基因设计的引物,扩增的片段大小约为175bp:
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