[发明专利]特异识别沙门氏菌的寡核苷酸适配子的用途有效

专利信息
申请号: 201210258657.9 申请日: 2012-07-25
公开(公告)号: CN102808022A 公开(公告)日: 2012-12-05
发明(设计)人: 余晓峰;张萍;宗凯;孙娟娟;李云飞;陈雪娇;郑海松 申请(专利权)人: 安徽出入境检验检疫局检验检疫技术中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/10;C12N15/115;G01N21/64
代理公司: 合肥金安专利事务所 34114 代理人: 金惠贞
地址: 230022 安*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 特异 识别 沙门氏菌 寡核苷酸 配子 用途
【说明书】:

发明领域

本发明属于生物学、食品与卫生检测技术领域,具体涉及特异识别沙门氏菌(血清型O8,以下简称沙门氏菌O8)的寡核苷酸适配子的用途。

背景技术

目前,国内外在食品中沙门氏菌检测时常用的检测方法因其检测手段、识别对象各有不同而各具优缺点。传统检测沙门氏菌的方法需要先分离再培养,然后用经典的方法鉴定,耗时、不灵敏是这些方法普遍存在的问题。免疫学方法简单、方便、迅速、特异性较好,但是仍有交叉反应比较严重、假阳性多、灵敏度偏低等不足之处。聚合酶链式反应(PCR)技术虽具有准确、灵敏、快速的特点,但其在检测数目较多的样品时操作比较繁杂,因此在聚合酶链式反应(PCR)技术的基础上又衍生出很多新型聚合酶链式反应(PCR)技术,如多重PCR技术,然而多重PCR虽简化了PCR实验的操作,但是由于该技术需数对引物同时进行扩增,很容易产生非特异性条带或假阳性,影响检测结果。

通过指数富集配体的系统进化(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技术筛选获得的寡核苷酸序列称为适配子(aptamer)。其原理就是利用分子生物学技术,构建人工合成的单链随机寡核苷酸文库,其随机序列长度在 20-100 个碱基左右,将随机寡核苷酸文库与靶分子相互作用,保留结合的寡核苷酸配基,经反复扩增、筛选数个循环,即可使与该靶子特异结合的寡核苷酸序列得到富集,最终获得靶分子的特异寡核苷酸配基。该技术具有库容量大、靶分子范围广、亲和力高、特异性强等优点。在临床检测方面,特别是对一些未知的致病性细菌或病毒的研究,虽然不知道其内部结构、功能以及这些物质的表位,但将其作为靶物质,通过SELEX技术筛选到其相应的适配子,以检测靶物质,已成为该领域的研究热点。

利用SELEX技术筛选获得的适配子识别分子的模式与蛋白抗体类似,但与蛋白类抗体相比,核酸类配基具有更多的优越性,如不受免疫条件和免疫源性限制,可体外人工合成,变性与复性可逆,可修饰并有利于长期保存和室温运输等。更重要的是,适配子的靶分子更为广泛,包括金属离子、有机染料、氨基酸、细胞因子、辅因子、氨基糖苷、抗生素、碱基类似物、核苷酸和多肽等。其中蛋白质类靶分子最多,包括酶、生长因子、抗体、转录因子、细胞粘附分子和选择素等。完整的病毒颗粒和细菌病原体,甚至完整的细胞也可以通过复合靶子SELEX技术或消减SELEX技术筛选出高亲和力的寡核苷酸配基。适配子比抗体具有更高的特异性和精确识别能力,甚至能识别单抗不能区分的蛋白质分子。这些特性使得适配子在生物医药和食品卫生研究领域得到广泛应用,成为不可缺少的有力工具。

发明内容

为了解决现有沙门氏菌检测中存在的检测周期长、灵敏度低、假阳性多等问题,本发明提供一种特异识别沙门氏菌的寡核苷酸适配子的应用。

特异识别沙门氏菌的寡核苷酸适配子的核苷酸序列如下:5'-GATCCGGGCCTCATGTCGAACACCCCCCAACTAAAACAACAAAACACCACCGCCATTGAGCGTTTATTCTGAGCTCCCA-3',特异识别沙门氏菌的寡核苷酸适配子是一条78个碱基长的单链DNA。本发明通过SELEX技术的筛选过程,获得高亲和性特异识别沙门氏菌的寡核苷酸适配子,用于快速、准确检测沙门氏菌O8。

本发明以食源性沙门氏菌O8为目的靶分子,同时以大肠杆菌O86:K61和猪霍乱沙门氏菌为反筛菌,获得了一条沙门氏菌O8特异的适配子。本方法具有检测时间短、研发周期短、质量稳定、操作简单等优点,在食品与卫生安全检测中得到广泛应用。

附图说明

图1为单链寡核苷酸(ssDNA)富集库与沙门氏菌O8结合率的测定结果图。

图2 A为寡核苷酸适配子10号与沙门氏菌O8灵敏度测定结果图。

图2 B为寡核苷酸适配子9号与沙门氏菌O8灵敏度测定结果图。

图3A为荧光显微镜观察荧光基团标记寡核苷酸适配子10号与大肠杆菌结合比较图。

图3B为荧光显微镜观察荧光基团标记寡核苷酸适配子10号与猪霍乱沙门氏菌结合比较图。

图3C为荧光显微镜观察荧光基团标记寡核苷酸适配子10号与沙门氏菌O8结合比较图。

图3D 为荧光显微镜观察荧光基团标记寡核苷酸适配子10号与双蒸水结合洗脱后空白对照图。

具体实施方式

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