[发明专利]ATP6V1B2基因突变体及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及ATP6V1B2基因突变体及其应用。具体地，本发明涉及分离的编码ATP6V1B2突变体的核酸、分离的多肽、筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的方法、筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的系统以及用于筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的试剂盒。

背景技术

先天性耳聋伴甲发育不良综合征（deafness and onychodystrohy syndrome,DOD）按遗传方式通常可分为两个特殊群体：常染色体隐性遗传的DOOR综合征（deafness–onychodystrohy–osteodystrophy-mental retardation syndrome）和常染色体显性遗传的DDOD综合征（dominant deafness and onychodystrohy syndrome）。DOOR综合征主要表现为先天性感音神经性聋、甲发育不良或缺失、拇指三节指骨以及不同程度的智力发育缓慢、癫痫、哑症等。此外，大多数DOOR综合征病人尿及血浆中α-酮戊二酸浓度增高。而DDOD综合征具有较轻的以上症状，即表现为先天性耳聋，甲发育不全，通常不涉及智力发育迟缓，无尿及血浆α-酮戊二酸的改变，圆锥形发育不全的牙齿也是DDOD综合征特点之一。而智力发育障碍是DOOR和DDOD综合征鉴别的重要特征。

然而，现阶段对先天性耳聋伴甲发育不良综合征，尤其是DDOD综合征，尚无有效的诊断、治疗方法，且DDOD综合征的致病基因尚未明确，因此，目前对DDOD综合征的研究仍有待深入。

发明内容

本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明的一个目的在于提出DDOD综合征（有时也称为“常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征”）的致病基因及其致病突变。

本发明是基于发明人的下列工作而完成的：发明人通过高通量外显子组测序联合候选基因突变验证的方法确定了常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的致病基因及其致病突变（ATP6V1B2，c.C1516T）。

根据本发明的第一方面，本发明提出了一种分离的编码ATP6V1B2突变体的核酸。根据本发明的实施例，该核酸与SEQ ID NO：1相比，具有c.C1516T突变。根据本发明的实施例，发明人确定了ATP6V1B2的突变体，该突变体与DDOD综合征的发病密切相关，从而通过检测该突变体在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征。

根据本发明的第二方面，本发明提出了一种分离的多肽。根据本发明的实施例，该多肽与SEQ ID NO：2相比，具有p.R506X突变。通过检测生物样品中是否表达该多肽，可以有效地检测生物样品是否易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征。

根据本发明的第三方面，本发明提出了一种筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的方法。根据本发明的实施例，该方法包括以下步骤：从生物样品提取核酸样本；确定所述核酸样本的核酸序列；所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO：1相比，具有c.C1516T突变是所述生物样品易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的指示。通过根据本发明实施例的筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征（即DDOD综合征）的生物样品的方法，可以有效地筛选易感DDOD综合征的生物样品。

根据本发明的第四方面，本发明提出了一种筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的系统。根据本发明的实施例，该系统包括：核酸提取装置，所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本；核酸序列确定装置，所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连，用于对所述核酸样本进行分析，以便确定所述核酸样本的核酸序列；判断装置，所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连，以便基于所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO：1相比，是否具有c.C1516T突变，判断所述生物样品是否易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征。利用该系统，能够有效地实施前述筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的方法，从而可以有效地筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品。