[发明专利]ATP6V1B2基因突变体及其应用有效
申请号: | 201210250240.8 | 申请日: | 2012-07-18 |
公开(公告)号: | CN103571846A | 公开(公告)日: | 2014-02-12 |
发明(设计)人: | 袁永一;戴朴;戴梅枝;王丽娟;吴婧;王俊;汪建;杨焕明 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军总医院;深圳华大基因科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12Q1/68;C12M1/34;C07K14/47 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 100853*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | atp6v1b2 基因 突变体 及其 应用 | ||
1.一种分离的编码ATP6V1B2突变体的核酸,其特征在于,与SEQ ID NO:1相比,所述核酸具有c.C1516T突变,
任选地,所述核酸为DNA。
2.一种分离的多肽,其特征在于,与SEQ ID NO:2相比,所述分离的多肽具有p.R506X突变,
任选地,所述多肽是由权利要求1所述的核酸编码的。
3.一种筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的方法,其特征在于,包括以下步骤:
从所述生物样品提取核酸样本;
确定所述核酸样本的核酸序列;
所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO:1相比,具有c.C1516T突变是所述生物样品易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的指示,
任选地,所述生物样品为选自人体血液、皮肤、毛发和肌肉的至少一种,
任选地,所述核酸样本为全基因组DNA。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,从所述生物样品提取核酸样本进一步包括:
从所述生物样品提取RNA样本,优选所述RNA样本为mRNA;以及
基于所述RNA样本,通过反转录反应,获得cDNA样本,所述cDNA样本构成所述核酸样本。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,确定所述核酸样本的核酸序列进一步包括:
针对所述核酸样本,构建核酸测序文库;以及
对所述核酸测序文库进行测序,以便获得由多个测序数据构成的测序结果,任选地,采用选自Hiseq2000、SOLiD、454和单分子测序装置的至少一种对所述核酸测序文库进行测序,
任选地,针对所述核酸样本,构建核酸测序文库进一步包括:
利用ATP6V1B2基因外显子特异性引物,对所述核酸样本进行PCR扩增;以及
针对所得到的扩增产物,构建所述核酸测序文库,
任选地,所述ATP6V1B2基因外显子特异性引物具有如SEQ ID NO:3-28所示的核苷酸序列。
6.一种筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的系统,其特征在于,包括:
核酸提取装置,所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本;
核酸序列确定装置,所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连,用于对所述核酸样本进行分析,以便确定所述核酸样本的核酸序列;
判断装置,所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连,以便基于所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO:1相比,是否具有c.C1516T突变,判断所述生物样品是否易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征。
7.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,所述核酸提取装置进一步包括:
RNA提取单元,所述RNA提取单元用于从所述生物样品提取RNA样本;以及
反转录单元,所述反转录单元与所述RNA提取单元相连,用于对所述RNA样本进行反转录反应,以便获得cDNA样本,所述cDNA样本构成所述核酸样本。
8.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,所述核酸序列确定装置进一步包括:
文库构建单元,所述文库构建单元用于针对所述核酸样本,构建核酸测序文库;以及
测序单元,所述测序单元与所述文库构建单元相连,用于对所述核酸测序文库进行测序,以便获得由多个测序数据构成的测序结果,
任选地,所述文库构建单元进一步包括:
PCR扩增模块,所述PCR扩增模块中设置有ATP6V1B2基因外显子特异性引物,以便利用ATP6V1B2基因外显子特异性引物,对所述核酸样本进行PCR扩增,
任选地,所述ATP6V1B2基因外显子特异性引物具有如SEQ ID NO:3-28所示的核苷酸序列,
任选地,所述测序单元包括选自HISEQ2000、SOLiD、454和单分子测序装置的至少一种。
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