[发明专利]高脂血症易感性无创检测试剂盒(APOB等基因)无效
| 申请号: | 201210235657.7 | 申请日: | 2012-07-10 |
| 公开(公告)号: | CN103540648A | 公开(公告)日: | 2014-01-29 |
| 发明(设计)人: | 郑俊斌 | 申请(专利权)人: | 解码(上海)生物医药科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 201203 上海市浦东*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 高脂血症易 感性 检测 试剂盒 apob 基因 | ||
技术领域
本项目属于分子生物学领域,涉及医学和生物技术,具体涉及一种高脂血症易感基因无创检测试剂盒,根据检测结果从基因层面评估高脂血症遗传易感性的风险级别,并作为高脂血症的建议指导。
背景技术
随着人们生活水平的提高,心脑血管疾病患者有逐年增加趋势,心脑血管疾病已成为继癌症之后导致人类死亡的又一大杀手! 大量研究表明:高脂血症(hyperlipidemia,HLP)等脂质代谢紊乱病症是引起心脑血管疾病不可忽视的重要原因。高脂血症是冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)、脑梗死、心脏猝死等疾病重要的危险因素,同时也是引起高血压、糖耐量异常、糖尿病等其他重要脏器病变的一个重要危险因素。高脂血症发病受遗传、环境和生活方式等多因素影响。在遗传因素的影响方面,现有研究发现多个基因与血脂水平相关,Apo B基因EcoR I位点多态性和MTHFR基因上C677T位点多态性均与HLP密切相关,可以作为受检者是否属于易患高脂血症人群的预测依据。而数据显示SLCO1B1基因多态性影响部分药物的治疗效果,因此该位点的基因型检测结果可以帮助医生给出用药建议。
人载脂蛋白B(apoprotein B,Apo B)作为低密度脂蛋白(LDL)受体的配体介导细胞内胆固醇的清除,在脂类转运和代谢过程中起着极其重要的作用。Apo B基因位于2号染色体短臂上,全长43kb,mRNA长度为14kb,可编码4536个氨基酸。研究表明该基因存在明显的多态性,其中EcoR I 位点与血脂异常相关,EcoR I多态性是由于外显子29中第4154位密码子突变(GAA-AAA),氨基酸序列上由赖氨酸取代谷氨酸。胡鹏等通过分析EcoR I位点多态性与血清总蛋白( TP)、白蛋白( AIB)、球蛋白a( GLO)、血脂、脂蛋白( Lpa)等的关系,表明点突变所造成的EcoR I酶切位点的部分或完全缺失,可以明显升高儿童血脂水平,同时降低血清蛋白水平,因而该位点可作为检测高脂血症指标之一。
亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)是血浆同型半胱氨酸(Hcy)再甲基化代谢的关键酶之一,由于基因突变导致酶活性降低往往会影响血浆Hcy水平。其中C677T突变常常引起轻至中度高同型半胱氨酸血症。MTHFR在C677T位点目的基因长度为198bp,677位基因座原有的碱基C突变为碱基T后可产生一个Hinf I限制性酶切位点,而野生型基因序列中无这一位点。研究表明MTHFR基因C677T位点多态性可能与高胆固醇血症相关,T等位基因突变可能是高胆固醇血症的危险因素。
有机阴离子转运多肽OATP1Bl(又称OATP-C,OATP2,LST1,编码基因SLCO1B1)是一种特异性分布于肝细胞基底膜上的一种转运蛋白,和体内诸多内源性或外源性物质的肝脏摄取作用关系密切。例如胆汁酸、硫化和葡萄糖醛酸化结合物、甲状腺激素、多肽、甲氨喋呤和他汀类药物等都是OATP1B1转运的底物。目前为止,OATP1B1基因上已陆续发现超过20种单核苷酸多态性(SNP)的突变,而这将会导致细胞对OATP1B1底物的摄取能力大大降低,并与转运功能异常有关。医学工作者通过对来自全国的24名健康男性基因分型及其对高脂血症常用药物匹伐他汀的吸收结果发现,52l T > C 突变组对匹伐他汀的吸收显著低于野生型521TT纯合子,这表明该基因的突变将降低对药物的正常吸收,进而影响高脂血症的治疗效果。
综上所述,鉴于ApoB基因、MTHFR基因和SLCO1B1基因在高脂血症发生过程中有着不可忽视的作用,可以将上述基因作为遗传易感因素来检测出受检者在高脂血症发生相关的基因单核苷酸位点基因型,及时筛查出易患高脂血症高危人群,从而根据检测结果尽早采取预防措施并提出治疗建议,这对于降低高脂血症发病率有非常重要的意义。
发明内容
基于 APOB基因上EcoRⅠ、MTHFR基因上C677T (rs1801133)、SLCO1B1基因上T521C (rs4149032)的3个单核苷酸多态性位点基因型可用来评估高脂血症发病风险级别,本发明提供一种高脂血症基因无创检测试剂盒。
该试剂盒包括:
检测 APOB基因上EcoRⅠ、MTHFR基因上C677T (rs1801133)、SLCO1B1基因上T521C (rs4149032)的3个单核苷酸多态性位点基因型的特异性引物对及DNA测序引物;
PCR反应组件(包括Taq酶、dNTP混合液、反应缓冲液、ddH2O等);
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