[发明专利]一种草鱼呼肠孤病毒RT-LAMP检测试剂盒及检测方法无效
申请号: | 201210186709.6 | 申请日: | 2012-06-07 |
公开(公告)号: | CN102703608A | 公开(公告)日: | 2012-10-03 |
发明(设计)人: | 张辉;曾令兵;周勇;范玉顶;徐进;张金风 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院长江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 王敏峰 |
地址: | 430223 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 草鱼 呼肠孤 病毒 rt lamp 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种草鱼呼肠孤病毒 RT-LAMP检测试剂盒,其特征在于,包括以下成分:
该试剂盒包括以下成分:1×ThermoPol Reaction Buffer;BstDNA聚合酶;dNTPs;AMV逆转录酶;外引物F3和B3、内引物FIP和BIP、Betaine,MgCl2,DTT, 1000×SYBR Green I;
F3:5,- CAGTGTGATCTCGACTTCCG - 3,
B3:5,- AGACCAACGCGTCAATCG -3,
FIP:5,- CGGTCGTCTGACGTACACCGTTTTTTGCCGGCATATGGGGTAA - 3,
BIP:5,- AGTTGGGTCAATTGGCTACGGTTTTTAGCACCATGGTACTGTTCG - 3,。
2.一种用权利要求1所述的试剂盒检测草鱼呼肠孤病毒的方法,其步骤是:
1)、病毒RNA的获取:
采用TRIzol?或TRIzol?LS试剂或柱吸附洗脱法提取样本总RNA;
2)、RT-LAMP扩增:
采用25μl反应体系:内引物FIP和BIP各0.8μM,外引物F3和B3各0.1μM,dNTPs1mM,Betaine0.5M,DTT4mM,MgCl2 2-10mM,Bst DNA聚合酶8U,AMV逆转录酶5U,模板RNA5μl,1×ThermoPol Reaction Buffer,选择55-65℃和30-120分钟进行RT-LAMP反应,80℃灭活2分钟;
3)、检测结果判定,采用下述三种方式之一:
A、发生扩增反应时,从dNTPs析出的焦磷酸根离子和反应液中的镁离子形成白色焦磷酸镁沉淀,通过肉眼判断:检测管出现明显浑浊为阳性,未见浑浊为阴性;
B、每25μl体系的反应管加1000×SYBR Green I 1-2μl,1-5 min观察结果,反应液变绿为阳性,保持橙色为阴性;
C、取扩增产物,用2%w/v的琼脂糖凝胶电泳后,置于凝胶成像系统中成像,电泳图片显示LAMP特征性梯状条带,则结果为阳性;如无任何条带,则结果为阴性。
3.根据权利要求2所述的一种检测草鱼呼肠孤病毒的方法,其特征在于:MgCl2 的浓度为8mM。
4.根据权利要求2所述的一种检测草鱼呼肠孤病毒的方法,其特征在于:反应温度为63℃。
5.根据权利要求2所述的一种检测草鱼呼肠孤病毒的方法,其特征在于:模板RNA在95℃5分钟后置于冰浴中进行预处理。
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